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一株降解PET单体对苯二甲酸的施氏假单胞菌的筛选和基因组分析
引用本文:刘盼,张彤,郑义,李庆宾,梁泉峰,祁庆生.一株降解PET单体对苯二甲酸的施氏假单胞菌的筛选和基因组分析[J].微生物学报,2022,62(1):200-212.
作者姓名:刘盼  张彤  郑义  李庆宾  梁泉峰  祁庆生
作者单位:山东大学微生物技术研究院, 山东 青岛 266237
基金项目:国家自然科学基金(31961133014);国家重点研发计划(2019YFA0706900)
摘    要:【目的】筛选和鉴定能够降解聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)单体的微生物,并分析代谢途径。【方法】从青岛小涧西固体废弃物综合处置厂采集样品,以PET单体对苯二甲酸为唯一碳源筛选获得能够代谢对苯二甲酸的菌株TPA3;16SrRNA序列分析确定TPA3菌株的分类地位;采用二代和三代高通量测序技术进行基因组de novo测序和分析;通过氨基酸序列比对分析TPA3菌株代谢对苯二甲酸和乙二醇的途径和基因;验证TPA3菌株的可遗传操作性。【结果】TPA3菌株被鉴定为施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri);它能够在30℃、220 r/min培养条件下,在30 h内消耗10.60g/L对苯二甲酸;经过驯化培养,也能够代谢乙二醇;其基因组由1条染色体和3个质粒组成,总大小约为4.55 Mb;推测该菌株具有经典的对苯二甲酸代谢途径以及与Pseudomonas putida KT2440相似的乙二醇代谢途径;采用假单胞菌遗传操作技术可对TPA3菌株进行遗传改造。【结论】TPA3菌株能够降解PET单体对苯二甲酸和乙二醇,并具有可遗传操作性,在PET废物生物处理技术中具有潜在的应用价值。

关 键 词:塑料污染  聚对苯二甲酸乙二醇酯  de  novo测序  代谢途径  遗传操作技术
收稿时间:2021/3/22 0:00:00
修稿时间:2021/5/15 0:00:00

Screening and genome analysis of a Pseudomonas stutzeri that degrades PET monomer terephthalate
LIU Pan,ZHANG Tong,ZHENG Yi,LI Qingbin,LIANG Quanfeng,QI Qingsheng.Screening and genome analysis of a Pseudomonas stutzeri that degrades PET monomer terephthalate[J].Acta Microbiologica Sinica,2022,62(1):200-212.
Authors:LIU Pan  ZHANG Tong  ZHENG Yi  LI Qingbin  LIANG Quanfeng  QI Qingsheng
Institution:State Key Laboratory of Microbial Technology, Shandong University, Qingdao 266237, Shangdong, China
Abstract:
Keywords:plastic pollution  polyethylene terephthalate  de novo sequencing  metabolic pathway  genetic manipulation technique
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