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阿卡波糖生物合成调控蛋白的钓取与功能解析
引用本文:汪雪梅,翁倩卉,赵芹芹,白林泉.阿卡波糖生物合成调控蛋白的钓取与功能解析[J].微生物学报,2021,61(11):3667-3685.
作者姓名:汪雪梅  翁倩卉  赵芹芹  白林泉
作者单位:上海交通大学生命科学技术学院, 微生物代谢国家重点实验室, 上海 200240
基金项目:国家自然科学基金(31830104)
摘    要:目的] 发现游动放线菌Actinoplanes sp.SE50/110中阿卡波糖生物合成的调控因子,并提高其产量。方法] 首先,利用DNA亲和层析技术,钓取与阿卡波糖生物合成基因簇2个双向启动子区域结合的调控蛋白。然后,在阿卡波糖产生菌QQ-2中强化表达或敲除这些调控蛋白编码基因,进行体内功能验证。同时,利用大肠杆菌BL21(DE3)异源表达获得可溶性蛋白,通过凝胶阻滞实验验证蛋白与启动子区域的结合能力。结果] 经DNA亲和层析及蛋白质质谱分析,钓取出9个与双向启动子PWVPAB结合的调控蛋白。在QQ-2中分别强化表达和缺失这9个调控基因后发现,基因ACPL_1889的强化表达使阿卡波糖产量提高25%,而该基因的缺失使产量降低22%;基因ACPL_5445、ACPL_3989的强化表达使阿卡波糖产量分别降低12%和39%,而这两个基因的缺失使产量分别提高15%和8%。对阿卡波糖生物合成基因转录水平的检测发现,强化表达基因ACPL_1889使acbA、acbB、acbW、acbV的转录水平升高,而缺失该基因使这4个基因的转录水平降低;敲除基因ACPL_5445使这4个基因转录水平均有提高;强化表达基因ACPL_3989使这4个基因的转录水平均下降,而其敲除使acbWacbA的转录水平分别提高了约100倍和40倍。在凝胶阻滞实验中,ACPL_1889与ACPL_3989均能与acb基因簇的启动子区域结合。最后将正调控基因的强化表达和负调控基因的敲除进行组合,使阿卡波糖产量提升32%。结论] 本研究发现了9个与阿卡波糖生物合成基因簇的启动子区域结合的调控蛋白,通过体内、体外实验证明ACPL_1889为阿卡波糖生物合成的正调控因子、ACPL_5445和ACPL_3989为负调控因子,不但为揭示阿卡波糖生物合成的转录调控机制奠定了基础,而且这些调控基因的改造显著提升了阿卡波糖的产量。

关 键 词:阿卡波糖  DNA亲和层析  转录调控  凝胶阻滞实验
收稿时间:2021/2/10 0:00:00
修稿时间:2021/3/3 0:00:00

Mining and function studies of regulators for acarbose biosynthesis in Actinoplanes sp. SE50/110
Xuemei Wang,Qianhui Weng,Qinqin Zhao,Linquan Bai.Mining and function studies of regulators for acarbose biosynthesis in Actinoplanes sp. SE50/110[J].Acta Microbiologica Sinica,2021,61(11):3667-3685.
Authors:Xuemei Wang  Qianhui Weng  Qinqin Zhao  Linquan Bai
Institution:State Key Laboratory of Microbial Metabolism, School of Life Sciences and Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China
Abstract:
Keywords:
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