| 北极海洋链霉菌604F的卤化酶基因克隆及特征 |
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| 引用本文： | 陈瑞勤,廖丽,张晓华,陈波.北极海洋链霉菌604F的卤化酶基因克隆及特征[J].微生物学报,2014,54(6):703-712. |
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| 作者姓名： | 陈瑞勤 廖丽 张晓华 陈波 |
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| 作者单位： | 华东理工大学生物工程学院，上海200237;中国极地研究中心，国家海洋局极地科学重点实验室，上海200136;中国海洋大学海洋生命学院，山东青岛266003;华东理工大学生物工程学院，上海200237 |
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| 基金项目： | 国家“863 计划”(2012AA092105);南北极环境综合考察与评估专项(CHINARE01-06);上海市自然科学基金项目(13ZR1462700) |
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| 摘 要： | 【目的】本研究旨在克隆来自北极海洋、具有合成卤化物潜力的链霉菌(Streptomyces sp.)604F中的一个卤化酶基因,为后续克隆卤化物合成基因簇、分离鉴定卤化物提供指导。【方法】利用琼脂块法初步测试抗菌活性,借助液相色谱-飞行时间串联质谱技术(LC-Tof MS)初步寻找Streptomyces sp.604F发酵粗提液中的卤化物,并以简并PCR扩增合成次级代谢产物的指示基因(I型、II型聚酮合酶及非核糖体多肽合成酶编码基因);根据依赖黄素腺嘌呤二核苷酸的卤化酶基因保守区设计的简并引物,扩增基因片段并测序分析;采用高效热不对称交错PCR(hiTAIL-PCR)技术扩增卤化酶基因全长。【结果】Streptomyces sp.604F具有较强的抗白色念珠菌活性,其基因组同时含有编码I型聚酮合酶、II型聚酮合酶和非核糖体多肽合成酶基因,以及卤化酶基因;通过染色体步移克隆该卤化酶基因全长,共1443 bp,编码一个新的非色氨酸卤化酶,在合成已知卤化物的卤化酶数据库中,与其同源关系最近的为一类参与合成糖肽类次级代谢产物的卤化酶。【结论】Streptomyces sp.604F具有新的非色氨酸卤化酶,且推测参与糖肽类化合物的卤化修饰,为后续寻找目的卤化物提供了指导,也为研究该合成基因簇奠定基础。
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| 关 键 词： | 卤化酶 放线菌 北极 |
| 收稿时间： | 2013/9/30 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2013/12/30 0:00:00 |
Cloning and analysis of a halogenase gene of Streptomyces sp. 604F from the Arctic Ocean |
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| Ruiqin Chen,Li Liao,Xiaohua Zhang and Bo Chen.Cloning and analysis of a halogenase gene of Streptomyces sp. 604F from the Arctic Ocean[J].Acta Microbiologica Sinica,2014,54(6):703-712. |
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| Authors: | Ruiqin Chen Li Liao Xiaohua Zhang and Bo Chen |
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