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纳豆芽胞杆菌16S rRNA基因的克隆及其系统进化分析
引用本文:覃宗华,蔡建平,叶秀华,王佩瑶,陈闻,王星,谢明权.纳豆芽胞杆菌16S rRNA基因的克隆及其系统进化分析[J].中国微生态学杂志,2005,17(5):324-326.
作者姓名:覃宗华  蔡建平  叶秀华  王佩瑶  陈闻  王星  谢明权
作者单位:广东省农科院兽医研究所,广州,广东,510640
基金项目:广州市科技局[穗科条字(2004)21号]资助
摘    要:纳豆芽胞杆菌是从豆豉中分离出的一种具有益生功能的芽胞杆菌。该研究从纳豆芽胞杆菌提取基因组DNA,以芽胞杆菌16S rRNA基因的通用引物,用PCR方法成功扩增出纳豆芽胞杆菌的部分16S rRNA基因,所克隆序列长1 435 bp,G+C含量为55%,该序列已被GeneBank收录,其编号为AY864812。BLAST分析结果显示,AY864812与GeneBank中收录的枯草芽胞杆菌16S rRNA基因同源性最高,其中与AY601722的同源性为100%.用Clustalx 1.8对相关序列进行系统进化分析,结果显示纳豆芽胞杆菌与枯草芽胞杆菌在进化关系上的地位最近,从分子水平上证实了纳豆芽胞杆菌是枯草杆菌的1个亚种。

关 键 词:纳豆芽胞杆菌  16S  rRNA基因  克隆
文章编号:1005-376X(2005)05-0324-03
修稿时间:2005年2月8日

Cloning and phylogenetic analysis of 16S rRNA gene of Bacillus subtilis natto
QIN Zong-hua,CAI Jian-ping,YE Xiu-hua,et al..Cloning and phylogenetic analysis of 16S rRNA gene of Bacillus subtilis natto[J].Chinese Journal of Microecology,2005,17(5):324-326.
Authors:QIN Zong-hua  CAI Jian-ping  YE Xiu-hua  
Abstract:Bacillus subtilis natto,isolated from soybean,was one kind of important and potential probiotics bacterium.But there were some taxonomic controversy between B.subtilis var.natto and B.subtilis.In this study,partial sequence of B.subtilis var.natto 16S rRNA gene was amplified by polymerase chain reaction(PCR) using the universal Bacillus primers,which its length was 1 435 base-pair(bp) and it was recorded in GeneBank and named as AY864812.The BLAST analysis and phylogenetic analysis indicated that AY864812 was the most similarity with reported 16S rRNA gene of B.subtilis.Therefore,it revealed that B.subtilis natto was a subspecies of B.subtilis.
Keywords:Bacillus subtilis natto  16S rRNA gene  Cloning
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