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粪便分离大肠埃希菌CRISPR系统在耐药及毒力中的作用
引用本文:李军,杨柳俏,于婷,陶晓燕,胡咏梅,王海晨,邹明祥.粪便分离大肠埃希菌CRISPR系统在耐药及毒力中的作用[J].中国微生态学杂志,2021,33(4):394-398.
作者姓名:李军  杨柳俏  于婷  陶晓燕  胡咏梅  王海晨  邹明祥
作者单位:中南大学湘雅医院检验科,湖南 长沙 410008
基金项目:国家自然科学基金青年科学基金(81702068);湖南省自然科学基金(2017JJ3478,2020JJ4886);2018年中南大学大学生创新类项目(ZY20180990);中南大学大学生创新类项目(S2020105330350)
摘    要:目的探索粪便分离大肠埃希菌成簇规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats, CRISPR)在耐药及毒力中的作用。方法收集某院2018年8-12月分离自慢性腹泻患者及健康体检者粪便样本的大肠埃希菌。采用纸片扩散法检测其药物敏感性,PCR法检测并比较分析腹泻患者及健康体检者粪便样本分离大肠埃希菌的系统发育群、耐药基因及CRISPR系统。结果共收集到142株大肠埃希菌,源于63例慢性腹泻患者(疾病组)和79例健康体检者(健康组)。药敏结果显示,氨苄西林耐药率为48.0%,其余抗菌药物敏感率为73.1%~100.0%。63株源于慢性腹泻患者粪便样本分离大肠埃希菌中CRISPR系统的检出率显著低于79株源于健康体检者(3.2%vs 46.8%,χ~2=33.538,P0.001)。在被检测的耐药基因中,63株疾病组中11株阳性(7株bla_(CTX-M-1)组、3株bla_(CTX-M-9)组和1株mcr-1),79株健康组中4株bla_(CTX-M-1)组,未携带耐药基因菌株中CRISPR系统的检出率显著高于携带耐药基因菌株(0.0%vs 29.9%,P=0.011)。43株高毒力菌株(B2群和D群)中CRISPR系统的检出率显著高于99株低毒力菌株(A群和B1群)(44.2%vs 20.2%,χ~2=8.656,P=0.003)。结论粪便分离大肠埃希菌对常用抗菌药物仍保持较高敏感性。CRISPR系统可能在粪便分离大肠埃希菌毒力及耐药基因的传播方面发挥重要作用。

关 键 词:慢性腹泻  药物敏感性  耐药基因  系统发育群  CRISPR系统

Effect of CRISPR system on drug resistance and virulence of Escherichia coli isolated from faecal specimen
LI Jun,YANG Liu qiao,YU Ting,TAO Xiao yan,HU Yong mei,WANG Hai chen,ZOU Ming xiang.Effect of CRISPR system on drug resistance and virulence of Escherichia coli isolated from faecal specimen[J].Chinese Journal of Microecology,2021,33(4):394-398.
Authors:LI Jun  YANG Liu qiao  YU Ting  TAO Xiao yan  HU Yong mei  WANG Hai chen  ZOU Ming xiang
Institution:Department of Clinical Laboratory, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, Hunan 410008, China
Abstract:
Keywords:Chronic diarrhea  Drug sensitivity  Drug resistance gene  Phylogenetic group  CRISPR system
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