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高通量测序检测肺炎婴幼儿抗生素治疗前后肠道菌群变化
引用本文:黄文献,王和平,王玉蕾,戴文魁,郑跃杰.高通量测序检测肺炎婴幼儿抗生素治疗前后肠道菌群变化[J].中国微生态学杂志,2016(5).
作者姓名:黄文献  王和平  王玉蕾  戴文魁  郑跃杰
作者单位:深圳市儿童医院呼吸内科,深圳市儿童医院呼吸内科,深圳市儿童医院呼吸内科,深圳市儿童医院呼吸内科,深圳市儿童医院呼吸内科
摘    要:目的了解抗生素对肺炎婴幼儿肠道菌群多样性和结构的影响。方法选取5例1岁以内因轻度社区获得性肺炎住院的患儿,收集抗生素治疗前及治疗后第3~5天的粪便标本。利用Illumina MiSeq测序平台,对细菌的16SrRNA基因V3~V4区进行高通量测序,并对测序结果进行生物信息学分析。结果抗生素治疗后第3~5天婴幼儿肠道菌群的多样性明显下降。变形菌门的相对丰度在3例婴幼儿的肠道中下降;厚壁菌门的相对丰度在4例婴幼儿的肠道中下降;而拟杆菌门的相对丰度在4例婴幼儿的肠道中上升;厚壁菌门与拟杆菌门的比例下降。肠道内不动杆菌属、喜胆汁菌属、埃格特菌属、肠球菌属、支原体、颤螺菌属、紫单胞菌属、普雷沃菌属和真杆菌属增长1倍以上;奇异菌属、双歧杆菌属、黄杆菌属、乳酸菌属、链球菌属、萨特菌属和韦荣球菌下降超过50%。结论婴幼儿短期使用抗生素治疗肺炎后,肠道菌群的多样性下降,肠道微生态失衡。

关 键 词:肠道菌群  婴幼儿肺炎  抗生素

High-throughput sequencing reveals the change of gut microbiota In infants with pneumonia following antibiotic treatment
Abstract:
Keywords:
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