植物复杂基因组与泛基因组研究现状与展望 |
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引用本文: | 王英豪,余嘉鑫,唐海宝,张兴坦.植物复杂基因组与泛基因组研究现状与展望[J].中国科学:生命科学,2024(2):233-246. |
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作者姓名: | 王英豪 余嘉鑫 唐海宝 张兴坦 |
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作者单位: | 1. 福建农林大学生命科学学院;2. 中国农业科学院深圳农业基因组研究所 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(批准号:32222019)资助; |
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摘 要: | 基因组是指一个生物体内遗传物质的总和,是生物学研究的关键之一.自2000年拟南芥基因组被测序发表以来,已有超过800个植物基因组相继被破解,极大促进了植物分子生物学、遗传学等领域的发展.即便如此,植物基因组学研究仍然面临一系列挑战,包括高杂合、高重复度、高倍性等复杂基因组的组装和泛基因组的构建等.本文从植物基因组学的发展概况、基因组测序技术、组装算法等三个方面,全面展示了植物基因组的快速发展.其中,介绍了简单基因组装和复杂基因组装的相关策略,总结了“端粒到端粒”(telomere-to-telomere或称T2T)的组装和泛基因组构建方法以及其重要性.最后,对未来植物基因组的发展进行了展望,认为随着技术的不断进步,基因组解析技术和方法将会更加完善,为植物基因组的深入研究提供更多支持.本文为植物T2T、复杂基因组组装和泛基因组的构建方法研究提供了参考依据.
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关 键 词: | 植物基因组学 测序技术 组装算法 植物复杂基因组 植物泛基因组 |
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