基于新一代测序方法的小鼠睾丸出生后发育的转录组研究 |
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引用本文: | 龚未,潘林林,林强,周媛媛,辛成齐,俞晓敏,崔鹏,胡松年,于军.基于新一代测序方法的小鼠睾丸出生后发育的转录组研究[J].中国科学:生命科学,2013,43(2):137-150. |
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作者姓名: | 龚未 潘林林 林强 周媛媛 辛成齐 俞晓敏 崔鹏 胡松年 于军 |
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作者单位: | 中国科学院北京基因组研究所, 基因组学与信息重点实验室, 北京 100029;
中国科学院大学, 北京 100049 |
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基金项目: | 国家重点基础研究发展计划(批准号: 2011CB944100, 2011CB944101)、国家自然科学基金(批准号: 90919024)、科技部科技基础工作专项(批准号: 2009FY120100)、国家高技术研究发展计划(批准号: 2012AA020409)资助项目 |
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摘 要: | 哺乳动物睾丸的发育是一个高度复杂而精密的过程.为了从转录组水平研究睾丸正常发育过程中的动态变化,本实验选取了出生后6日龄、4周龄和10周龄的3组小鼠,分别代表其幼年期、青春期以及成年期.应用超高通量的新一代测序技术(RNA-seq),获得了2.11亿条长度为35bp的序列,鉴定出18837个基因,并且发现表达量最高的基因均与精子发生相关.同时,也发现6日龄小鼠睾丸的基因表达谱明显有别于4和10周龄,表明4周龄小鼠已进入性发育期.本文分析了睾丸发育过程中大量与精子发生和体细胞发育相关的基因,找到了MAPK,Hedgehog和Wnt等信号通路在睾丸不同发育阶段中所起的重要作用.这些研究结果加深了对睾丸发育的分子调控机制的认识.本研究也表明新一代测序技术在转录组研究中具有很大优势.
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关 键 词: | 新一代测序 转录组 小鼠睾丸 发育 |
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