蕨类植物psbD基因的适应性进化和共进化分析 |
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引用本文: | 许可,王博,苏应娟,高磊,王艇.蕨类植物psbD基因的适应性进化和共进化分析[J].武汉植物学研究,2013(5):429-438. |
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作者姓名: | 许可 王博 苏应娟 高磊 王艇 |
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作者单位: | [1]中国科学院植物种质创新与特色农业重点实验室,中国科学院武汉植物园,武汉430074 [2]中国科学院大学,北京100049 [3]中山大学生命科学学院,广州510275 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(31070594);湿地演化与生态恢复湖北省重点实验室开放课题. |
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摘 要: | D2蛋白是植物光系统Ⅱ复合体(PSⅡ)核心蛋白之一,由叶绿体psbD基因编码。为了深入理解核心薄囊蕨类植物在阴生环境下的“辐射”式演化,我们对12种蕨类植物的psbD基因进行了克隆和测序,然后联合已公布的其他8种蕨类植物的psbD序列,基于ω值(非同义替换率ds和同义替换率ds的比值)探讨了该基因经受的选择压力。发现D2蛋白在大多数分支和位点受到强烈的负选择,但是树蕨类分支的psbD进化速率低且ω值较高。借助多种模型进行的共进化分析显示,树蕨类D2蛋白的168R、245H和272M两两组成具有共进化关系的氨基酸位点对。
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关 键 词: | 核心薄囊蕨 psbD基因 选择压力 共进化 |
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