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DRE顺式作用元件dsDNA芯片制备
引用本文:张玉宝,郭志鸿,李同祥,王亚军,谢忠奎.DRE顺式作用元件dsDNA芯片制备[J].武汉植物学研究,2009,27(2):188-192.
作者姓名:张玉宝  郭志鸿  李同祥  王亚军  谢忠奎
作者单位:1. 中国科学院寒区旱区环境与工程研究所皋兰生态与农业综合试验站,兰州,730000
2. 中国科学院寒区旱区环境与工程研究所皋兰生态与农业综合试验站,兰州,730000;兰州大学生命科学学院,兰州,730000
基金项目:中国科学院农业项目办公室资助项目 
摘    要:DRE顺式作用元件能与DREB转录因子特异结合,在诱导逆境(干旱、高盐、低温)基因表达过程中起重要作用。dsDNA(double strand DNA)微阵列芯片技术能够有效地检测序列特异性DNA结合蛋白质(转录因子)与大量DNA靶点(顺式作用元件)的特异性结合,可有效分析生物分子结合作用。根据DRE顺式作用元件核心序列设计并化学合成含发夹结构的单链DNA探针,采用Taq DNA聚合酶在片延伸,并对其在片延伸体系的反应温度、Mg^2+浓度以及单链探针是否变性等条件进行了优化。结果表明,50%的反应温度,2.5mmol/L的Mg^2+浓度和单链不变性是TaqDNA聚合酶在片延伸的最佳条件。优化方法制备的dsDNA芯片将更有利于DRE顺式作用元件与DREB抗逆转录因子相互作用的研究。

关 键 词:DRE顺式作用元件  DREB转录因子  双链DNA芯片

Manufacture of dsDNA Microarrays of DRE Cis-acting Element
ZHANG Yu-Bao,GUO Zhi-Hong,LI Tong-Xiang,WANG Ya-Jun,XIE Zhong-Kui.Manufacture of dsDNA Microarrays of DRE Cis-acting Element[J].Journal of Wuhan Botanical Research,2009,27(2):188-192.
Authors:ZHANG Yu-Bao  GUO Zhi-Hong  LI Tong-Xiang  WANG Ya-Jun  XIE Zhong-Kui
Institution:ZHANG Yu-Bao, GUO Zhi-Hong , LI Tong-Xiang, WANG Ya-Jun , XIE Zhong-Kui( 1. Gaolan Experiment Station for Ecology and Agriculture Research, Cold and Arid Regions Environmental and Engineering Research Institute Chinese Academy of Sciences, Lanzhou 730000, China; 2. School of Life Science, Lanzhou University, Lanzhou 730000, China)
Abstract:
Keywords:
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