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| 桃ERF转录因子家族生物信息学分析及芽萌发相关基因筛选 | |
| 引用本文： | 赵雪惠,王庆杰,李晨,陈修德,肖伟,高东升,付喜玲.桃ERF转录因子家族生物信息学分析及芽萌发相关基因筛选[J].植物学报,2018,53(5):612-624. |
| 作者姓名： | 赵雪惠 王庆杰 李晨 陈修德 肖伟 高东升 付喜玲 |
| 作者单位： | 山东农业大学园艺科学与工程学院, 泰安 271018 山东农业大学作物生物学国家重点实验室, 泰安 271018 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金(No.31372050)、山东农业大学科技创新团队-设施园艺优势团队(No.SYL2017YSTD07)和山东省自然科学基金(No.ZR2017BC036) |
| 摘 要： | 以中油四号油桃(Prunus persica var.nectarina)为研究对象,利用MEGA 6.0、MEME、GSDS和DNAMAN 6.0等软件对桃ERF家族数据进行生物信息学分析,鉴定得到102个ERF转录因子家族基因,并通过构建系统进化树将这102个基因分为10个子家族(I–X)。基因结构分析表明,有81个基因不含内含子,20个基因含有1个内含子,有1个基因与其它成员差异较大,含有5个内含子。保守元件分析表明,ERF家族包含20个保守元件,其中Motif 1、Motif 2和Motif 4都属于AP2/ERF结构域,同一个保守元件主要出现在同一个子家族中,并且大部分保守元件的功能未知。VIII子家族基因的荧光定量PCR分析表明,在桃叶芽处于不同的发育状态时,Ppe ERF068的表达量存在较大差异,光照培养箱中培养的桃芽在萌发过程中各时期表达量变化趋势进一步表明该基因可能与叶芽萌发有关,将其命名为Ppe EBB1。该研究为进一步揭示Ppe EBB1的分子机制奠定了基础,并为桃树的栽培管理和熟期调控了提供理论指导。 |
| 关 键 词： | 桃 ERF家族 芽萌发 PpeEBB1" target="_blank">PpeEBB1')">PpeEBB1 |
| 收稿时间： | 2017-06-15 |
Genome-wide Identification of Ethylene Responsive Factor (ERF) Family Genes in Peach and Screening of Genes Related to Germination |
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| Zhao Xuehui,Wang Qingjie,Li Chen,Chen Xiude,Xiao Wei,Gao Dongsheng,Fu Xiling.Genome-wide Identification of Ethylene Responsive Factor (ERF) Family Genes in Peach and Screening of Genes Related to Germination[J].Bulletin of Botany,2018,53(5):612-624. | |
| Authors: | Zhao Xuehui Wang Qingjie Li Chen Chen Xiude Xiao Wei Gao Dongsheng Fu Xiling |
| Institution: | College of Horticulture Science and Engineering, Shandong Agricultural University, Tai’an 271018, China; State Key Laboratory of Crop Biology, Shandong Agricultural University, Tai’an 271018, China; |
| Abstract: | |
| Keywords: | peach ERF family bud germination PpeEBB1" target="_blank">PpeEBB1')">PpeEBB1 |
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