| 甘薯盐胁迫响应基因IbMYB3的表达特征及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李格,孟小庆,李宗芸,朱明库.甘薯盐胁迫响应基因IbMYB3的表达特征及生物信息学分析[J].植物学报,2020,55(1):38-48. |
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| 作者姓名： | 李格 孟小庆 李宗芸 朱明库 |
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| 作者单位： | 江苏师范大学生命科学学院/江苏省药用植物生物技术重点实验室, 徐州 221116 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31700226);国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-10-B3);江苏师范大学博士教师科研启动基金(15XLR030);江苏高校优势学科建设工程(PAPD) |
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| 摘 要： | MYB转录因子具有多种生物学功能,在植物响应生物和非生物胁迫中发挥重要作用。该文从盐胁迫后的甘薯(Ipomoea batatas)水培苗转录组数据(RNA-seq)中筛选出2个受盐胁迫显著上调表达的MYB基因,分别命名为IbMYB3和IbMYB4。多种非生物胁迫和植物生长物质处理下的基因表达分析显示,IbMYB3受逆境诱导显著上调表达,暗示其可能参与甘薯非生物胁迫响应。生物信息学分析表明,IbMYB3开放阅读框长度为1059 bp,编码353个氨基酸残基,蛋白分子量为39.41 kDa,理论等电点(PI)为5.26,为酸性带负电的亲水性蛋白。亚细胞定位结果表明,IbMYB3蛋白定位于细胞核,具有较强的转录激活活性。上述结果表明,IbMYB3转录因子可能在甘薯非生物胁迫响应过程中发挥重要调控作用,研究结果为进一步探明IbMYB3基因的功能奠定了基础。
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| 关 键 词： | 生物信息学分析 表达特征 IbMYB3 甘薯 转录激活 |
| 收稿时间： | 2019-05-22 |
Expression Patterns and Bioinformatic Analyses of Salt Stress Responsive Gene IbMYB3 in Ipomoea batatas |
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| Ge Li,Xiaoqing Meng,Zongyun Li,Mingku Zhu.Expression Patterns and Bioinformatic Analyses of Salt Stress Responsive Gene IbMYB3 in Ipomoea batatas[J].Bulletin of Botany,2020,55(1):38-48. |
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| Authors: | Ge Li Xiaoqing Meng Zongyun Li Mingku Zhu |
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| Institution: | Key Lab of Biotechnology for Medicinal Plants of Jiangsu Province/School of Life Science, Jiangsu Normal University, Xuzhou 221116, China |
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