| 大豆KNOX基因家族的结构和表达分析 |
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| 引用本文： | 李方正,杨素欣,吴春霞,魏海超,曲瑞莲,冯献忠.大豆KNOX基因家族的结构和表达分析[J].植物学报,2012,47(3):236-247. |
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| 作者姓名： | 李方正 杨素欣 吴春霞 魏海超 曲瑞莲 冯献忠 |
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| 作者单位： | 山东师范大学生命科学学院, 山东省高校系统生物学重点实验室, 济南 250014 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金重大研究计划(No.91131008);山东省自然科学杰出青年基金(No.JQ200909) |
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| 摘 要： | KNOX基因家族编码同源异型盒蛋白, 在植物生长发育过程中起重要调控作用。利用生物信息学手段在全基因组水平上对大豆(Glycine max)KNOX家族基因进行鉴定和分类, 并分析其基因结构、蛋白同源结构域特征以及基因表达方式。研究结果表明: 大豆中的27个GmKNOX基因可以分为GmKNOX I和GmKNOX II两个亚类, 其中GmKNOX I类可分为3个主要的进化支, GmKNOX II类分为2个主要的进化支; 26个GmKNOX基因不均匀地分布在16条染色体上, GmKNOX27尚无法定位。不同组织表达谱的分析表明: GmKNOX I类基因表达部位比较集中, 以茎顶端分生组织中表达量最高; 而GmKNOX II类基因的表达特异性较GmKNOX I类低, 表达部位更广泛。
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| 关 键 词： | 表达谱分析 基因结构 KNOX基因家族 大豆 |
| 收稿时间： | 2012-01-19 |
| 修稿时间： | 2012-04-01 |
Structure and Expression Analysis of KNOX Gene Family in Soybean |
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| Fangzheng Li, Suxin Yang, Chunxia Wu, Haichao Wei, Ruilian Qu, Xianzhong Feng.Structure and Expression Analysis of KNOX Gene Family in Soybean[J].Bulletin of Botany,2012,47(3):236-247. |
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| Authors: | Fangzheng Li Suxin Yang Chunxia Wu Haichao Wei Ruilian Qu Xianzhong Feng |
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| Institution: | Key Laboratory of Systems Biology in Universities of Shandong, College of Life Sciences, Shandong Normal University, Jinan 250014, China |
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| Abstract: | KNOX family genes, coding homeobox proteins, play an important role in plant development. We investigated soybean KNOX family genes with genome database analysis and bioinformatics. Phylogenetic analysis characterized 2 classes of GmKNOX genes: GmKNOX I with 3 sub-classes and GmKNOX II with 2. In total, 26 GmKNOX genes distribute in 16 chromosomes of soybean, and GmKNOX27 could not be located in any chromosome. Whole-genome expression analysis revealed class I GmKNOX genes mainly expressed in meristematic tissues and class II GmKNOX genes broadly expressed in different tissues. |
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| Keywords: | expression profiles gene structure KNOX gene family soybean |
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