| 红花microRNAs靶基因的生物信息学预测 |
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| 引用本文： | 董园园,李海燕,李校堃,杨树林.红花microRNAs靶基因的生物信息学预测[J].中国生物工程杂志,2012,32(10):33-38. |
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| 作者姓名： | 董园园 李海燕 李校堃 杨树林 |
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| 作者单位： | 1. 南京理工大学环境与生物工程学院 南京 210094;2. 吉林农业大学生物反应器与药物开发教育部工程研究中心 长春 130118 |
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| 基金项目： | 国家“863”计划(SQ2010AA1000691008);国家自然科学基金(30971804)资助项目 |
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| 摘 要： | miRNA是一类动、植物细胞中负责转录后调控的非编码RNA,植物的miRNA通常来源于具有茎环结构的单链RNA前体上,加工成熟后同ARGONAUTE转变成蛋白复合体结构,通过结合并沉默蛋白合成模板的方式关闭完整的基因表达网络。由于miRNA存在组织表达的特异性,且miRNA在植物中的表达高度保守。通过高通量测序获得的红花(Carthamus tinctorious L.)miRNA序列信息与红花转录EST数据库比对,通过靶基因预测筛选,对属于104个家族的173个红花miRNA进行预测,其中得到109个miRNAs对应调控的385个红花靶基因。并且通过Nr基因注释表明多数红花miRNA的靶基因编码包括调控细胞生长发育、信号转导及新陈代谢等相关的功能蛋白。
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| 关 键 词： | 红花 靶基因预测 microRNA |
| 收稿时间： | 2012-05-25 |
Bioinformatics Prediction of microRNAs and Targets from Safflower |
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| DONG Yuan-yuan,LI Hai-yan,LI Xiao-kun,YANG Shu-lin.Bioinformatics Prediction of microRNAs and Targets from Safflower[J].China Biotechnology,2012,32(10):33-38. |
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| Authors: | DONG Yuan-yuan LI Hai-yan LI Xiao-kun YANG Shu-lin |
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| Institution: | 1(1 School of Environmental and Biological Engineering,Nanjing University of Science and Technology,Nanjing 210094,China)(2 Engineering Research Center of Bioreactor and Pharmaceutical Development,Ministry of Education, Jilin Agricultural University,Changchun 130118,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Safflower Target prediction microRNA |
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