| 用SARS冠状病毒全基因组芯片杂交方法分析SARS-CoV |
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| 引用本文： | 吴小兵,任鲁风,马鑫,何新洲,袁振华,刘凤杰,赵革新,杨宇,张猛,董小岩,侯云德.用SARS冠状病毒全基因组芯片杂交方法分析SARS-CoV[J].中国生物工程杂志,2003,23(7):89-93. |
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| 作者姓名： | 吴小兵 任鲁风 马鑫 何新洲 袁振华 刘凤杰 赵革新 杨宇 张猛 董小岩 侯云德 |
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| 作者单位： | 1. 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制研究所病毒基因工程国家重点实验室, 北京 100052;
2. 本元正阳基因技术股份有限公司, 北京 100176 |
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| 摘 要： | 为从临床样品中检测和分析SARSCoV病毒打基础,并为分析SARSCoV病毒的复制和转录等机理提供一种有效方法。以SARS冠状病毒TOR2株序列作为标准设计和制备一种覆盖SARS冠状病毒全基因组的寡聚核苷酸芯片,探针长度为70nt,每相邻的探针序列重复25nt,共660条。用该芯片分析了细胞培养的SARSCoV病毒总RNA、7个SARSCoV病毒的基因克隆片段。对RNA样品用随机引物进行反转录PCR获得cDNA。对DNA用随机引物扩增和dUTPcy3标记。结果用这种芯片杂交检测SARSCoV病毒RNA可见阳性信号呈全基因组分布,并且有多处连续的阳性信号点;用正常人的白细胞RNA为对照,杂交未出现明显阳性信号。检测7个SARSCoV病毒基因克隆片段,在该片段相应的探针区段出现连续阳性信号点。这种方法可有效地检测和分析样品中SARS冠状病毒全基因组的信息。
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| 关 键 词： | SARS冠状病毒(SARS-CoV) 全基因组 基因芯片 全基因组扩增 |
Analysis of SARS Coronavirus by Oligonucleotide(70mer)Microarray Hybridization |
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| Wu Xiaobing , Ren Lufeng Ma Xin He Xinzhou Yuan Zhenhua Liu Fengjie Zhao Gexin Yang Yu Zhang Meng Dong Xiaoyan Hou Yunde.Analysis of SARS Coronavirus by Oligonucleotide(70mer)Microarray Hybridization[J].China Biotechnology,2003,23(7):89-93. |
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| Authors: | Wu Xiaobing Ren Lufeng Ma Xin He Xinzhou Yuan Zhenhua Liu Fengjie Zhao Gexin Yang Yu Zhang Meng Dong Xiaoyan Hou Yunde |
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| Institution: | 1 National Laboratory of Molecular Virology and Genetic Engineering Chinese Centre for Disease Control and Prevention 2 AGTC Gene Technology Company LTD. |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Whole viral genome SARS-CoV DNA microarray Whole genome aplification |
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