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Bst DNA聚合酶大片段在全基因组扩增中的应用
引用本文:张心愿,邓佳,刘馨,陈琳,林峻,蔡伟文.Bst DNA聚合酶大片段在全基因组扩增中的应用[J].中国生物工程杂志,2016,36(7):48-54.
作者姓名:张心愿  邓佳  刘馨  陈琳  林峻  蔡伟文
作者单位:1 福州大学应用基因组学研究所 福州 350108; 2 福州大学生物科学与工程学院 福州 350108
基金项目:国家自然科学基金(31371287,31301537,31571300),福建省科技重大专项(2013YZ0002-1,2013YZ0002-2)资助项目
摘    要:Bst DNA聚合酶大片段作为一种常用的DNA聚合酶,因其独特的特点:能引发链置换反应、高保真、耐高温等,而成为一种重要的DNA多重置换扩增酶。目的:为减少成本,设计一种高产,方便且扩增活性高的Bst DNA聚合酶大片段表达体系;探究该酶应用于胃癌石蜡包埋组织基因组DNA的扩增条件。方法:采用p TWIN1质粒作为载体克隆表达Bst DNA聚合酶大片段,应用几丁质亲和层析柱纯化该酶,使用该酶对人类基因组DNA进行不同温度下扩增,探究其最适反应温度,并据此对胃癌石蜡包埋组织基因组DNA进行扩增。结果:由此得到的Bst DNA聚合酶大片段能运用于胃癌石蜡包埋组织基因组DNA的扩增,扩增效率可达200倍,并能应用于a CGH芯片。结论:扩增得到保真性高,覆盖基因组范围大的DNA扩增产物。该应用与a CGH结合,使得对少量的癌症石蜡包埋组织DNA样本进行全基因组扩增,并进行其基因拷贝数变异研究成为可能。

关 键 词:多重置换扩增  石蜡包埋组织  Bst  全基因组扩增  DNA聚合酶大片段  
收稿时间:2015-12-28

Bst DNA Polymerase Large Fragment for Whole Genome Amplification
ZHANG Xin-yuan,DENG Jia,LIU Xin,CHEN Lin,LIN Jun,CAI Wei-wen.Bst DNA Polymerase Large Fragment for Whole Genome Amplification[J].China Biotechnology,2016,36(7):48-54.
Authors:ZHANG Xin-yuan  DENG Jia  LIU Xin  CHEN Lin  LIN Jun  CAI Wei-wen
Abstract:
Keywords:Multiple displacement amplification  Bst DNA polymerase large fragment  Formalin-fixed  Whole genome amplification  paraffin-embedded  
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