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凋亡和周期基因芯片研究As2O3对NB4细胞凋亡相关基因表达谱的影响
引用本文:狄春红,杨磊,和桂芬,仙玲,谭晓华,吴奇涵,季朝能,顾少华.凋亡和周期基因芯片研究As2O3对NB4细胞凋亡相关基因表达谱的影响[J].中国生物工程杂志,2005,25(11):12-16.
作者姓名:狄春红  杨磊  和桂芬  仙玲  谭晓华  吴奇涵  季朝能  顾少华
作者单位:1. 复旦大学生命科学院遗传学研究所遗传工程国家重点实验室, 上海 200433; 2. 石河子大学新疆地方与民族高发病省部共建教育部重点实验室, 石河子 832002
基金项目:上海市科学技术委员会科研计划资助项目(045458032)
摘    要:目的:利用细胞凋亡和周期基因芯片研究As2O3作用前后NB4细胞基因表达谱的差异性,寻找As2O3诱导NB4细胞凋亡的相关基因并分析其可能机制。方法:流式细胞仪检测细胞凋亡率,抽提对照及诱导组细胞的mRNA,通过逆转录将As2O3处理前后的NB4细胞cDNA进行生物素标记,用含269个目的基因的细胞凋亡和周期基因芯片进行杂交,GEArray软件分析,筛选出As2O3诱导前后表达有差异的基因。芯片结果用荧光定量聚合酶链反应(realtimepolymerasechainreaction)进行验证。结果:筛选出As2O3作用前后表达有差异的基因共100条(占芯片基因总数的37.2%),其中97条(97/100,97%)基因表达上调,3条(3/100,3%)基因表达下调。表达上调的基因主要包括肿瘤坏死因子配体和受体家族、bcl2家族、半胱氨酸家族、DNA损伤检测和P53途径以及细胞分裂周期蛋白和激酶等基因。结论:As2O3主要通过上调促凋亡基因表达来诱导NB4细胞凋亡,其中TNFSF15、Apaf1、Caspase3和p16等基因可能参与As2O3诱导的NB4细胞凋亡,As2O3诱导NB4细胞凋亡的可能机制主要涉及TNF途径、线粒体途径、Caspase途径、细胞周期抑制途径和P53途径等。

关 键 词:As2O3  NB4细胞  细胞凋亡和周期基因芯片  基因表达谱  
收稿时间:2005-06-30
修稿时间:2005-06-302005-08-25

Investigation on the Effect of Arsenic Trioxide on the Apoptosis- associated Gene Expression Profile of NB4 Cells by Human Apoptosis and Cell Cycle Gene Array
DI Chun-hong,YANG Lei,HE Gui-fen,XIAN Ling,TAN Xiao-hua,WU Qi-han,JI Chao-neng,GU Shao-hua.Investigation on the Effect of Arsenic Trioxide on the Apoptosis- associated Gene Expression Profile of NB4 Cells by Human Apoptosis and Cell Cycle Gene Array[J].China Biotechnology,2005,25(11):12-16.
Authors:DI Chun-hong  YANG Lei  HE Gui-fen  XIAN Ling  TAN Xiao-hua  WU Qi-han  JI Chao-neng  GU Shao-hua
Institution:1. State Key Laboratory of Genetic Engineering, Institute of Genetics, School of Life Science, Fudan University Shanghai 200433, China;2 Key Laboratory of Xinjiang Endernie and Ethical Disease, Ministry of Education, Shihezi University Shihezi 832002, China
Abstract:
Keywords:Arsenic trioxide NB4 cells Human Apoptosis and Cell Cycle Gene Array Gene expression profile
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