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柠条锦鸡儿肉桂酰辅酶A还原酶基因克隆和分析
引用本文:李高,杨杞,张烨,王颖,张涛,李国婧,王瑞刚.柠条锦鸡儿肉桂酰辅酶A还原酶基因克隆和分析[J].中国生物工程杂志,2014,34(1):50-56.
作者姓名:李高  杨杞  张烨  王颖  张涛  李国婧  王瑞刚
作者单位:1. 内蒙古农业大学生命科学学院 呼和浩特 010018;2. 中国林业科学研究院林业研究所 北京 100091;3. 鄂尔多斯市食品药品检验研究中心 鄂尔多斯 017000
基金项目:教育部新世纪优秀人才支持计划(ECNT-11-1020);教育部博士学科点基金博导类联合资助项目(20111515110001);国家自然科学基金(31060105);内蒙古自然科学基金重点(2010Zd13)资助项目
摘    要:肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase,CCR)是木质素特异合成途径中的关键酶。根据已报道的植物CCR基因序列设计简并引物,利用RACE技术,首次从柠条锦鸡儿(Caragana korshinkii Kom.)中克隆得到CCR基因全长cDNA序列,命名为CkCCR,GenBank登录号为HQ829859。该序列长1 270bp,具备长度为1 014bp的完整开放阅读框(ORF)。推导该基因编码的蛋白质有434个氨基酸,预测等电点6.69,分子量36.76kDa。序列分析发现,柠条锦鸡儿CCR基因推导的氨基酸序列与其它植物来源的CCR序列高度相似,并且具有植物CCR共有的氨基酸序列"KNWYCYGKA"以及NADPH的结合序列。系统进化分析显示,柠条锦鸡儿CCR与拟南芥CCR2处于同一分支,与同属豆科的银合欢CCR亲缘关系最近。利用荧光定量PCR技术对柠条锦鸡儿一个月龄幼苗基因转录水平进行检测,结果显示CkCCR基因在根、茎、叶中广泛表达,并且干旱处理初期表达量有所下降,处理后期又恢复到未处理时的表达水平。

关 键 词:柠条锦鸡儿  CCR  RACE  序列分析  
收稿时间:2013-01-22
修稿时间:2013-10-10

Cloning and Analysis of the Gene Encoding Cinnamoyl-CoA Reductase from Caragana korshinkii Kom
LI Gao,YANG Qi,ZHANG Ye,WANG Yin,ZHANG Tao,WANG Rui-gang,LI Guo-jing.Cloning and Analysis of the Gene Encoding Cinnamoyl-CoA Reductase from Caragana korshinkii Kom[J].China Biotechnology,2014,34(1):50-56.
Authors:LI Gao  YANG Qi  ZHANG Ye  WANG Yin  ZHANG Tao  WANG Rui-gang  LI Guo-jing
Institution:1. College of Life Sciences, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, China;2. Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Beijing 100091, China;3. The Ordos Food and Drug Inspection and Research Center, Ordos 017000, China
Abstract:
Keywords:Caragana korshinskii Kom    CCR RACE  Sequence analysis
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