| 全基因组扩增策略在基因芯片分析SARS冠状病毒实验中的应用 |
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| 引用本文： | 赵革新,任鲁风,刘凤杰,何新舟,董小岩,吴小兵,侯云德.全基因组扩增策略在基因芯片分析SARS冠状病毒实验中的应用[J].中国生物工程杂志,2004,24(3):54-58. |
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| 作者姓名： | 赵革新 任鲁风 刘凤杰 何新舟 董小岩 吴小兵 侯云德 |
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| 作者单位： | 1. 本元正阳基因技术股份有限公司, 北京 100176;
2. 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制研究所病毒基因工程国家重点实验室, 北京 100052 |
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| 摘 要： | 针对SARS冠状病毒的分子生物学检测是控制SARS流行的关键环节。为评价全基因组扩增对SARS微量样本检测的影响 ,采用 6 mer随机引物反转录 ,用加接头的随机引物合成第二链 ,再以接头序列为引物扩增并掺入荧光标记 ,最后与带有 70 mer探针的基因芯片杂交。此非特异方法基本覆盖了样本中的全部DNA ,结果发现SARS冠状病毒全基因组的扩增效果对基因芯片杂交结果的均匀性有较大影响 ,PCR循环次数增多会导致扩增均匀性的降低。分析了不同的引物对全基因组扩增均匀性的影响 ,探讨了全基因组扩增策略的缺陷。
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| 关 键 词： | SARS冠状病毒 全基因组扩增 基因芯片 |
| 收稿时间： | 2003-11-25 |
| 修稿时间： | 2003年11月25 |
Strategy of Whole Genome Amplification in Analysis of SARS Coronavirus with Microarray |
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| ZHAO Ge xin REN Lu feng LIU Feng jie HE Xin zhou DONG Xiao yan WU Xiao bing , HOU Yun de.Strategy of Whole Genome Amplification in Analysis of SARS Coronavirus with Microarray[J].China Biotechnology,2004,24(3):54-58. |
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| Authors: | ZHAO Ge xin REN Lu feng LIU Feng jie HE Xin zhou DONG Xiao yan WU Xiao bing HOU Yun de |
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| Institution: | ZHAO Ge xin 1 REN Lu feng 1 LIU Feng jie 1 HE Xin zhou 1 DONG Xiao yan 1 WU Xiao bing 1,2 HOU Yun de 2 |
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| Abstract: | SARS Coronavirus detection by molecular biological method is the key step to control the prevalence of SARS.In order to evaluate the influence of whole genome amplification on SARS CoV detection in minimum amount of specimen,the virus whole genome was amplified by a random primer method and combined it with microarray hybridization.The efficiency of the SARS whole genome amplification had prominent influence on the detection result.The fidelity in SARS whole genome amplification and the amplification effect by different primers were analyzed.The disadvantages of the strategy of whole genome amplification were also discussed. |
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| Keywords: | SARS-CoV Whole Genome Amplification Microarray |
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