| 江苏省2013—2014年3株柯萨奇病毒B组5型流行株全基因组序列分析 |
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| 引用本文： | 卞莲莲,姚昕,高帆,孙世洋,毛群颖,杨晓明,梁争论.江苏省2013—2014年3株柯萨奇病毒B组5型流行株全基因组序列分析[J].微生物学免疫学进展,2019(2):9-16. |
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| 作者姓名： | 卞莲莲 姚昕 高帆 孙世洋 毛群颖 杨晓明 梁争论 |
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| 作者单位： | 1.中国食品药品检定研究院肝炎病毒疫苗室;2.武汉生物制品研究所有限责任公司 |
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| 基金项目： | 十三五科技重大专项(2016ZX09101120) |
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| 摘 要： | 目的分析引起江苏省疱疹性咽峡炎的柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5, CV-B5)毒株基因组特征。方法对江苏省2013—2014年3例疱疹性咽峡炎患儿临床标本进行病原分离,获得3株CV-B5毒株,进行全基因组序列测定,与GenBank中世界各地不同年份CV-B5流行株序列进行比对分析,使用Mega 5.2软件构建系统进化树,并应用Simplot软件进行重组分析。结果获得3株CV-B5毒株,分别命名为417/JS/CHN/2013、492/JS/CHN/2013和759/JS/CHN/2014,均属于GI.D3亚型,且在位点5 224～5 696 bp(以Faulkner为参考株)与2008年北京市的CV-B3流行株(GQ141875)发生重组,在位点5 696 bp之后与2009年昆明市的CV-B3流行株(JX843810)发生重组。结论 CV-B5在婴幼儿人群中的感染可能存在严重危害,应加强对CV-B5的分子流行病学研究,监测可能发生的重组。
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| 关 键 词： | 柯萨奇病毒B组5型 基因组 重组 分析 |
Analysis of full genome for coxsackievirus B5 strains circulating from 2013 to 2014 in Jiangsu Province |
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| BIAN Lian-lian,YAO Xin,GAO Fan,SUN Shi-yang,MAO Qun-ying,YANG Xiao-ming,LIANG Zheng-lun.Analysis of full genome for coxsackievirus B5 strains circulating from 2013 to 2014 in Jiangsu Province[J].Progress In Microbiology and Immunology,2019(2):9-16. |
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| Authors: | BIAN Lian-lian YAO Xin GAO Fan SUN Shi-yang MAO Qun-ying YANG Xiao-ming LIANG Zheng-lun |
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| Institution: | (Division of Hepatitis Virus Vaccines,National Institutes for Food and Drug Control,Beijing 100050,China) |
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| Abstract: | BIAN Lian-lian;YAO Xin;GAO Fan;SUN Shi-yang;MAO Qun-ying;YANG Xiao-ming;LIANG Zheng-lun(Division of Hepatitis Virus Vaccines,National Institutes for Food and Drug Control,Beijing 100050,China) |
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| Keywords: | Coxsackievirus B5 Genome Recombination Analysis |
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