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猪的全基因组水平SNP研究现状
引用本文:陈慧勇,罗赛群,吴珍芳.猪的全基因组水平SNP研究现状[J].生命科学,2011(4):390-393.
作者姓名:陈慧勇  罗赛群  吴珍芳
作者单位:中南大学生物科学与技术学院分子生物学研究中心;华南农业大学动物科技系;
基金项目:国家高技术研究发展计划(“863”计划)(2008AA101008); 高等学校博士学科点专项科研基金/新教师基金项目(20090162120026)
摘    要:SNP(single nucleotide polymorphism,单核苷酸多态)在猪基因组中的分布极其广泛,平均分布间隔为300~400 bp,相关数据库收录已达55万条。猪基因组测序已取得实质性进展,大规模搜索发现基因组及EST(expressed sequence tag)序列中的SNP已展开,应用于猪全基因组水平的SNP芯片已建立。在此基础上,基于猪SNP标记的遗传图谱绘制、QTL(quantitative trait loci)定位、遗传多样性检测及全基因组关联分析等也都相继出现。

关 键 词:  SNP  全基因组关联分析

Progresses of SNP in pig genome-wide studies
CHEN Hui-Yong,LUO Sai-Qun,WU Zhen-Fang.Progresses of SNP in pig genome-wide studies[J].Chinese Bulletin of Life Sciences,2011(4):390-393.
Authors:CHEN Hui-Yong  LUO Sai-Qun  WU Zhen-Fang
Institution:CHEN Hui-Yong1,LUO Sai-Qun1,WU Zhen-Fang2*(1 Molecular Biology Research Center,College of Biological Science and Technology,Central South University,Changsha 410078,China,2 Department of Animal Science,South China Agricultural University,Guangzhou 510640,China)
Abstract:Single nucleotide polymorphisms(SNPs) are abundant and widespread throughout the pig genome,occurring typically on average every 300-400 bps.About 557 k SNPs have been deposited in NCBI's SNP repository dbSNP.The pig whole genome is currently being sequenced with billions of sequences completed.Hundreds of thousands of porcine SNPs are discovered in genome sequence data and expressed sequence tag(EST) collections.High density SNP genotyping assays are designed for porcine genome.Therefore,the extensive appl...
Keywords:pig  SNP  genome wide association study  
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