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计算方法在蛋白质相互作用研究中的应用
引用本文:曹建平,马义才,李亦学,石铁流.计算方法在蛋白质相互作用研究中的应用[J].生命科学,2005,17(1):82-87.
作者姓名:曹建平  马义才  李亦学  石铁流
作者单位:1. 电子科技大学生命科学与技术学院,成都,610054
2. 中国科学院上海生命科学研究院生物信息中心,上海,200031
基金项目:国家“863”项目(2002AA231051)
摘    要:计算方法在蛋白质相互作用研究的各个阶段扮演了一个重要的角色。对此,作者将从以下几个方面对计算方法在蛋白质相互作用及相互作用网络研究中的应用做一个概述:蛋白质相互作用数据库及其发展;数据挖掘方法在蛋白质相互作用数据收集和整合中的应用;高通量方法实验结果的验证;根据蛋白质相互作用网络预测和推断未知蛋白质的功能;蛋白质相互作用的预测。

关 键 词:蛋白质相互作用数据库  蛋白质功能预测  蛋白质相互作用网络  蛋白质间相互作用
文章编号:1004-0374(2005)01-0082-06
修稿时间:2004年12月3日

The application of the computational methods in protein-protein interaction study
CAO Jian-ping,MA Yi-Cai,LI Yi-xue,SHI Tie-Liu.The application of the computational methods in protein-protein interaction study[J].Chinese Bulletin of Life Sciences,2005,17(1):82-87.
Authors:CAO Jian-ping  MA Yi-Cai  LI Yi-xue  SHI Tie-Liu
Institution:CAO Jian-Ping1,MA Yi-Cai1,LI Yi-Xue2,SHI Tie-Liu2*
Abstract:Computational methods play an important role at all stages of the process of determining protein-protein interactions. Here, computational methods dealing with protein-protein interactions and interactionnetwork are discussed from five aspects: interaction databases with their construction and development;automated data mining techniques developed to extract information about interactions from the publishedliterature; computational methods used for the assessment of the results of high-throughput approaches;exploitation of the information provided by protein interaction networks for predicting functional features ofthe proteins; computational methods adopted for predicting protein-protein interactions.
Keywords:protein interaction database  protein function prediction  protein interaction networks  protein-protein interaction
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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