白毛黑眼兔眼部虹膜Trp1、Trp2基因克隆与分析

目的 克隆日本大耳白兔白毛黑眼系(白毛黑眼兔)眼部虹膜Trp1、Trp2基因,获取其完整的外显子序列.进一步推测这两个基因编码的蛋白,并分析其特征.方法 从白毛黑眼兔的黑色虹膜组织中提取RNA,并反转录成cDNA.利用来自小鼠、大鼠和人的同源引物,扩增获得白毛黑眼兔Trp1、Trp2基因外显子片段.然后对已知片段进行3' RACE和5'RACE,从而获得白毛黑眼兔Trp1、Trp2基因外显子完整序列.利用相关软件对获得序列进行翻译和分析.结果 首次获得了白毛黑眼兔Trp1、Trp2基因外显子全序列.该实验兔Trp1基因的编码序列全长1604个碱基,其核苷酸序列与人的相似度为87.9％,与小鼠的相似度为82.7％.TRP1成熟蛋白包含513氨基酸,氨基酸序列与人的相似度为89.8％,与小鼠的相似度为86.6％.该实验兔Trp2基因序列全长1554个碱基,其核苷酸序列与人的相似度为83.2％,与小鼠的相似度为81.9％.TRP2成熟蛋白包含494个氨基酸,其序列与人的一致度为84.2％,与小鼠的一致度为84.4％.结论 本研究获得的TRP1、TRP2的序列与已知的家兔酪氨酸相关蛋白家族成员TYR的序列进行比对,结果显示这三种蛋白之间有较高的相似度,并且TRP1和TRP2蛋白序列表现出了酪氨酸酶家族结构上的保守性和特有的结构特征.

Cloning and analysis of Trp1 and Trp2 genes from white hair black eyes rabbit iris