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鼻咽癌细胞系CNE2中NPCEDRG基因mRNA剪接变异体的分析
引用本文:侯德富,关勇军,关瑞,万恂恂,李国庆,欧阳咏梅,余艳辉,陈主初.鼻咽癌细胞系CNE2中NPCEDRG基因mRNA剪接变异体的分析[J].中国生物化学与分子生物学报,2011,27(9):841-850.
作者姓名:侯德富  关勇军  关瑞  万恂恂  李国庆  欧阳咏梅  余艳辉  陈主初
作者单位:中南大学湘雅医院卫生部肿瘤蛋白质组学重点实验室;中南大学肿瘤研究所;湖南师范大学医学院生物化学与分子生物学教研室;南华大学药学与生命科学学院生物科学系;
基金项目:国家自然科学基金项目(No.30772401)~~
摘    要:NPCEDRG基因是采用基因定位候选克隆策略获得的1个鼻咽癌候选抑瘤基因. NPCEDRG在鼻咽癌细胞和组织中表达下调,重新恢复NPCEDRG基因在CNE2细胞系的表达,可部分逆转CNE2 的恶性表型. 本研究对CNE2细胞所表达的NPCEDRG基因mRNA剪接变异体克隆、鉴定,发现NPCEDRG基因至少有7个转录起始位点,其中NM_032316的TSS位于ATG上游-85 nt处,AF538150和AK094248的TSS位于-25 nt处;AF538150不存在第2外显子中6核苷酸序列(5′-TTGCAG-3′)的缺失,其CDs为516 bp,编码1种由171个氨基酸组成的蛋白质(而非GenBank中公布的CDs为510 bp,1种由169个氨基酸组成的蛋白质). 本研究成功克隆得到1种新的NPCEDRG基因的mRNA剪接变异体V2,其TSS位于-23 nt处,其CDs为297 bp,编码1种由98个氨基酸组成的蛋白质.

关 键 词:NPCEDRG基因    mRNA剪接变异体    5-RACE    3-RACE    RT-PCR  
收稿时间:2011-05-04

Analysis of NPCEDRGAlternative Splicing Variants in NPC Cell Line CNE2
HOU De-Fu ,,GUAN Yong-Jun ,GUAN Rui ,WAN Xun-Xun ,LI Guo-Qing ,OUYANG Yong-Mei ,YU Yan-Hui ,CHEN Zhu-Chu , Key Laboratory of Cancer Proteomics of Chinese Ministry of Health,Xiangya Hospital,Central South University,Changsha ,China, Cancer Institute,Xiangya School of Medicine,.Analysis of NPCEDRGAlternative Splicing Variants in NPC Cell Line CNE2[J].Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology,2011,27(9):841-850.
Authors:HOU De-Fu      GUAN Yong-Jun  GUAN Rui  WAN Xun-Xun  LI Guo-Qing    OUYANG Yong-Mei  YU Yan-Hui  CHEN Zhu-Chu  Key Laboratory of Cancer Proteomics of Chinese Ministry of Health  Xiangya Hospital  Central South University  Changsha  China  Cancer Institute  Xiangya School of Medicine  
Institution:HOU De-Fu 1),2),3),GUAN Yong-Jun 2),GUAN Rui 1),WAN Xun-Xun 1),LI Guo-Qing 1),4),OUYANG Yong-Mei 2),YU Yan-Hui 2),CHEN Zhu-Chu 1),2)(1) Key Laboratory of Cancer Proteomics of Chinese Ministry of Health,Xiangya Hospital,Central South University,Changsha 410008,China,2) Cancer Institute,Xiangya School of Medicine,3) Department of Biochemistry and Molecular Biology,Medical College of Hunan Normal University,Changsha 410013,4) Department of Biolo...
Abstract:
Keywords:NPCEDRG  alternative splicing variants  5′-RACE  3′-RACE  RT-PCR  
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