半夏miR167及其靶基因响应大豆花叶病毒胁迫的表达 |
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引用本文: | 王晨燕,杜江,马振男,张丽,王德富,牛颜冰.半夏miR167及其靶基因响应大豆花叶病毒胁迫的表达[J].中国生物化学与分子生物学报,2023(5):724-733. |
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作者姓名: | 王晨燕 杜江 马振男 张丽 王德富 牛颜冰 |
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作者单位: | 1. 山西农业大学生命科学学院;2. 山西农业大学草业学院 |
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基金项目: | 山西农业大学科技创新基金项目(No.2020BQ51);;国家现代农业产业技术体系(No.CARS-21)资助~~; |
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摘 要: | MicroRNAs(miRNAs)是一类小的非编码RNA,在植物逆境及生物胁迫中通过调节靶基因来发挥重要的调控作用。半夏内源miR167是否参与了大豆花叶病毒(soybean mosaic virus,SMV)的胁迫及相互作用关系尚不清楚。本研究利用茎环法扩增半夏内源miR167基因,命名为pt-miR167,采用生物信息学软件对其进行保守性分析,系统进化性分析及靶基因预测。在此基础上,采用qRT-PCR技术检测病毒积累量、miR167及其潜在的靶基因的表达水平,分析miR167及靶基因响应病毒侵染的表达模式。结果表明,病毒积累量在5~15 d时迅速增加,其中10 d时增加最快,随后呈现缓慢上升趋势。病毒侵染后,pt-miR167相比对照组,表达量呈下调,并且在10 d时表达量最低。进化树分析表明,pt-miR167与番茄(Solanum lycopersicum)中的sly-miR167a聚为一族,高度同源。预测的潜在主要靶基因ARF6表达量与pt-miR167表达量呈现正好相反的趋势,其在10 d时表达量达到最高。本研究表明,miRNA167参与了寄主半夏与病毒SMV的相互作用关系...
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关 键 词: | 半夏 大豆花叶病毒 miR167 靶基因 表达模式 |
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