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树鼩载脂蛋白E的cDNA和蛋白质结构分析
引用本文:张坚,曾武威,陈保生,吴钢,张文成,张可满.树鼩载脂蛋白E的cDNA和蛋白质结构分析[J].中国生物化学与分子生物学报,2002,18(1):9-13.
作者姓名:张坚  曾武威  陈保生  吴钢  张文成  张可满
作者单位:中国医学科学院基础医学研究所,中国协和医科大学基础医学院医学分子生物学国家重点实验室,北京,100005
基金项目:国家攀登计划资助项目 (恶性肿瘤和心血管疾病的基础理论研究 ),国家自然基金资助课题 (No .39770 16 8)
摘    要:以从树肝脏mRNA逆转录得到的Ⅰ链cDNA为模板 ,运用SMARTRACEPCR技术 ,扩增得到树载脂蛋白E(apoE)cDNA序列 ,并推导出apoE蛋白质的氨基酸序列 .利用分子生物学软件包PCGENE对氨基酸序列和二级结构进行分析和比较 .结果表明 ,树apoEcDNA序列 (作为新基因已被GenBank接收 ,登录号为AF 30 3830 )由 1138bp构成 ,其中 5′非翻译区 6 4bp ,3′非翻译区 135bp ,939bp组成一个完整开放阅读框架 ,与人apoEcDNA的同源性为 86 % .编码 313个氨基酸组成的apoE前体 ,包含 18个氨基酸构成的信号肽和 2 95个氨基酸组成的成熟蛋白 .与人apoE氨基酸序列的同源性为 78% .树apoE与人及其它种属动物apoE在氨基酸组成上相近 ,但比人apoE少4个氨基酸 ,比动脉粥样硬化易感动物家兔apoE多 2个氨基酸 .经Garnier法预测 ,树apoE蛋白二级结构与人apoE相似 ,螺旋构象 (helical) 6 9 9% ,伸展构象 (extended) 16 6 % ,转角构象 (turn)6 0 % ,无规则卷曲 (coil) 7 6 % .

关 键 词:树鼩  载脂蛋白E  cDNA  蛋白质结构  
收稿时间:2002-02-20
修稿时间:2001年3月6日

Analysis of Apolipoprotein E cDNA and Protein Structure of Tree Shrew
ZHANG Jian,ZENG Wu wei,CHEN Bao sheng ,WU Gang,ZHANG Wen cheng,ZHANG Ke man.Analysis of Apolipoprotein E cDNA and Protein Structure of Tree Shrew[J].Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology,2002,18(1):9-13.
Authors:ZHANG Jian  ZENG Wu wei  CHEN Bao sheng   WU Gang  ZHANG Wen cheng  ZHANG Ke man
Institution:(Institute of Basic Medical Sciences, Chinese Academy of Medical Sciences, School of Basic Medical Sciences, Peking Union Medical College, National Laboratory of Me
Abstract:
Keywords:tree shrew    apolipoprotein E    cDNA  protein structure
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