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荧光热漂移实验体外检测核小体的解聚
引用本文:郭明欣,张凤慧,邵学勤,赵秀娟,蔡禄,赵宏宇.荧光热漂移实验体外检测核小体的解聚[J].中国生物化学与分子生物学报,2019,35(9):1021-1028.
作者姓名:郭明欣  张凤慧  邵学勤  赵秀娟  蔡禄  赵宏宇
作者单位:(内蒙古科技大学 生命科学与技术学院,内蒙古 包头014010)
基金项目:国家自然科学基金项目(No. 31760247,No. 61671256)和内蒙古自然科学基金项目(No. 2017MS0303)
摘    要:核小体是真核生物染色质的基本组成单元。核小体的解聚可以动态调控诸如DNA复制、转录、重组等以DNA为模板的生物学过程。特定荧光探针分子与蛋白质疏水残基结合后可被激发荧光信号。荧光热漂移(fluorescence thermal shift,FTS)是一种利用该原理检测温度上升时蛋白质变性过程的方法。本文以Widom 601序列为DNA模板,盐透析法体外装配核小体;分别在实时荧光定量PCR仪的VIC和TAMRA通道激发下,利用FTS检测了核小体在Tris-NaCl(TN)缓冲液和HEPES缓冲液中的解聚状态。研究结果发现,DNA对照序列在TN缓冲液中产生的背景噪声较大,VIC通道激发下组蛋白八聚体产生的荧光信号相对较强。FTS检测核小体的结果显示,随着温度的上升核小体的解聚过程分为2个阶段,~71℃和~84℃是核小体解聚速度最快的温度范围,而75℃~80℃是降解速度较慢的阶段。基于FTS基本原理,本研究发展了一种新颖的可用于检测核小体结构稳定性的方法,为核小体与染色质结构相关问题的研究奠定了一定的技术基础。

关 键 词:核小体解聚  荧光热漂移  蛋白质疏水结构域  染色质结构  
收稿时间:2019-04-23

Fluorescence Thermal Shift Assay Detects Depolymerization of Nucleosomes in vitro
GUO Ming-Xin,ZHANG Feng-Hui,SHAO Xue-Qin,ZHAO Xiu-Juan,CAI Lu,ZHAO Hong-Yu.Fluorescence Thermal Shift Assay Detects Depolymerization of Nucleosomes in vitro[J].Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology,2019,35(9):1021-1028.
Authors:GUO Ming-Xin  ZHANG Feng-Hui  SHAO Xue-Qin  ZHAO Xiu-Juan  CAI Lu  ZHAO Hong-Yu
Institution:(School of Life Science and Technology, Inner Mongolia University of Science and Technology, Baotou 014010, Inner Mongolia, China);
Abstract:
Keywords:
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