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酵母SOD1基因缺失突变体应答刚果红胁迫的转录组学分析
引用本文:张小华,刘向勇,卞伟华,许聪,武玉永,张昭杰.酵母SOD1基因缺失突变体应答刚果红胁迫的转录组学分析[J].中国生物化学与分子生物学报,2015,31(9):960-966.
作者姓名:张小华  刘向勇  卞伟华  许聪  武玉永  张昭杰
基金项目:山东省自然科学基金(No.ZR2012CQ041)和烟台市科技发展计划项目(No.2013ZH097)
摘    要:SOD1基因编码的铜锌超氧化物歧化酶是酵母细胞中最重要的抗氧化酶. 前期研究发现,SOD1基因缺失(sod1Δ)导致酵母细胞对真菌细胞壁抑制剂刚果红(Congo red, CR)的敏感性增加,提示细胞抗氧化能力与细胞壁稳定性相关. 本研究采用酵母全基因组表达谱芯片,比较了CR胁迫条件下,野生型酵母细胞和sod1Δ酵母细胞的转录表达谱. 结果表明,与野生型酵母细胞相比,sod1Δ酵母细胞中260个基因发生了显著差异表达(140个基因表达上调、120个基因表达下调). 随机选取12个差异表达基因采用定量PCR验证,结果与芯片分析结果一致. 差异表达基因功能主要涉及细胞壁(几丁质合成)、细胞代谢、细胞防御(抗氧化和热冲击蛋白)、蛋白质合成以及大量功能未知基因. 进一步研究发现,CR处理后,细胞壁几丁质含量和细胞内氧化应激指标丙二醛(MDA)含量在sod1Δ酵母细胞中显著升高,而在野生型酵母细胞中无明显变化,与芯片筛选差异表达基因的生物学功能分析结果一致. 本研究提供了在全基因组水平上对SOD1基因与细胞壁应激反应之间关联的新认识.

关 键 词:铜锌超氧化物歧化酶  细胞壁  DNA芯片  氧化胁迫  酵母  
收稿时间:2015-02-28
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