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DNA芯片技术中利用内标对数据归一化后检测基因的表达变化
引用本文:张亮,张坚,周玉祥,程京.DNA芯片技术中利用内标对数据归一化后检测基因的表达变化[J].中国生物化学与分子生物学报,2002,18(1):115-119.
作者姓名:张亮  张坚  周玉祥  程京
作者单位:1. 清华大学生物技术与科学系清华大学生物技术与科学系;生物芯片北京国家工程研究中心,北京,100084
2. 清华大学生物技术与科学系清华大学生物膜与膜国家重点实验室,北京,100084;清华大学生物膜与膜国家重点实验室,北京,100084;生物芯片北京国家工程研究中心,北京,100084
基金项目:国家自然科学基金 (No .398890 0 1,No.3982 5 10 8)和国家重点基础研究 项目 (G19990 116 )
摘    要:在DNA芯片技术中 ,通过反转录反应 ,由mRNA合成带有荧光标记物的cDNA的过程中 ,往往要参入已知质量的poly(A) + RNA ,以对DNA芯片的检测灵敏度进行归一化处理 .通过体外转录的方法 ,以真核生物的cDNA克隆中的DNA片段为模板合成poly(A) +RNA ,对之定量后 ,以不同的质量比参入到样品的反转录体系中 ,代表不同的RNA拷贝丰度 ,从而对DNA芯片检测的灵敏度进行了定量 ,并得到DNA芯片上杂交点的荧光信号强度与基因表达的RNA拷贝数成正相关的关系 .利用含有内标的DNA芯片检测了热击反应后酵母细胞的基因表达变化 ,结果与Northern印迹方法检测结果是相符的

关 键 词:DNA芯片  内标  poly(A)+RNA  体外转录  基因表达  
收稿时间:2002-02-20
修稿时间:2001年3月19日

Normalization of cDNA Microarray Data Using Exogenous Nucleic Acid Control in Gene Differential Expression Determination
ZHANG Liang ,ZHANG Jian ,ZHOU Yu xiang ,,CHENG Jing ,.Normalization of cDNA Microarray Data Using Exogenous Nucleic Acid Control in Gene Differential Expression Determination[J].Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology,2002,18(1):115-119.
Authors:ZHANG Liang    ZHANG Jian    ZHOU Yu xiang      CHENG Jing    
Institution:( 1) Department of Biological Science and Technology, Tsinghua University, Beijing 100084,China, 2) State key Laboratory of Biome
Abstract:
Keywords:
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