| 我国两株登革2型病毒5′和3′端非编码区序列测定及二级结构分析 |
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| 引用本文： | 赵卫,宋海峰,杨敬,胡志君,杨佩英,秦鄂德,于曼.我国两株登革2型病毒5′和3′端非编码区序列测定及二级结构分析[J].中国生物化学与分子生物学报,2001(1). |
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| 作者姓名： | 赵卫 宋海峰 杨敬 胡志君 杨佩英 秦鄂德 于曼 |
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| 作者单位： | 军事医学科学院微生物流行病研究所!北京100071，军事医学科学院微生物流行病研究所!北京100071，军事医学科学院微生物流行病研究所!北京100071，军事医学科学院微生物流行病研究所!北京100071，军事医学科学院微生物流行病研究所!北京100071，军事医学科学院微生物流行病研究所!北 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金!课题 (No.39770 0 36和 30 0 0 0 14 4 ) |
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| 摘 要： | 为测定我国两株临床症状、乳鼠神经毒力不同的登革 2型病毒流行株 5′和 3′端非编码区序列 (untranslated region,UTR) ,分析二级结构差异与毒力变化的关系 ,分别从 D2 - 0 4、D2 - 44株感染的 C6/ 36细胞及鼠脑中提取总 RNA.以该 RNA为模板 ,利用 RACE法 ,分别扩增了 D2 - 0 4、D2 -44株的 5′和 3′末端 c DNA片段 .将其分别与 p GEM- T载体连接得到重组质粒 ,测定上述 c DNA插入片段的序列 .用 RNAdraw软件预测 D2 - 0 4、D2 - 44株 5′和 3′端非编码区的二级结构 .D2 - 0 4、D2 -44株 5′端和 3′端非编码区分别有 96和 454个核苷酸 .其中 5′非编码区 59位 C(D2 - 0 4 )→T(D2 -44 ) ,使 D2 - 44二级结构稳定性下降 ;3′端非编码区有 1 5个核苷酸不同 ,其中 T(355)→ A,T(32 6)→ G引起了所在位置二级结构自由能变化 ,且分别位于两个保守序列区 (conserved sequence,CS)CS1、CS2 A.这些位点变化可能与毒力有关 .
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| 关 键 词： | 登革2型病毒 5′和3′末端 序列分析 |
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