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鸡二价金属转运蛋白1 cDNA的克隆与序列分析
引用本文:白世平,吕林,罗绪刚,刘彬.鸡二价金属转运蛋白1 cDNA的克隆与序列分析[J].中国生物化学与分子生物学报,2008,24(6):574-580.
作者姓名:白世平  吕林  罗绪刚  刘彬
作者单位:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所矿物元素营养研究室,北京,100094;动物营养学国家重点实验室,北京,100094
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973计划) , 中国农业科学院一级岗位杰出人才专项经费资助项目
摘    要:鸡二价金属转运蛋白1(divalent metal transporter 1, DMT1)在动物胃肠道锰吸收过程中起重要作用.根据哺乳动物Dmt1同源蛋白氨基酸序列的保守性设计引物,应用3′RACE(rapid amplification of cDNA ends)技术,扩增并克隆获得鸡小肠Dmt1 cDNA 3′端1 289bp和1 092bp的2种片段,发现其3′端翻译区和非翻译区存在差异. 根据鸡Dmt1 cDNA 3′端片段的测序结果设计引物,扩增获得1个与3′端片段部分重叠的鸡Dmt1 cDNA 5′端907 bp片段,并对其进行了克隆测序. 根据鸡小肠Dmt1 3′RACE片段和5′RACE片段序列信息进行拼接,从而获得鸡小肠Dmt1 cDNA全序列信息.结果表明,鸡小肠Dmt1 cDNA有2种形式,1种全长为1 972个核苷酸,其中5′非翻译区为104个核苷酸,编码区1 695个核苷酸,3′非翻译区为173个核苷酸,编码1个含564个氨基酸残基的蛋白质;另1种形式为1 775个核苷酸,其中5′非翻译区为104个核苷酸,编码区1 593个核苷酸,3′非翻译区为78个核苷酸,编码1个含530个氨基酸残基的蛋白质.据鸡Dmt1 cDNA推测出的2种形式蛋白质的氨基酸序列与人、大鼠和小鼠的Dmt1蛋白具有高度同源性,它们的同源性分别为82%、82%、80%,和 84%、84%、83%. 对推测氨基酸序列进行疏水性和跨膜区分析表明,Dmt1蛋白为1种跨膜整合蛋白,具有膜转运蛋白糖基化位点和底物结合位点的保守序列.

关 键 词:二价金属转运蛋白1(DMT1)  鸡小肠  cDNA  RACE  序列分析  
收稿时间:2007-11-19

Cloning and Sequence Analysis of Divalent Metal Transporter 1 cDNA of Chickens
BAI Shi-Ping,L Lin,LUO Xu-Gang,LIU Bin.Cloning and Sequence Analysis of Divalent Metal Transporter 1 cDNA of Chickens[J].Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology,2008,24(6):574-580.
Authors:BAI Shi-Ping  L Lin  LUO Xu-Gang  LIU Bin
Institution:BAI Shi-Ping,L(U) Lin,LUO Xu-Gang,LIU Bin
Abstract:
Keywords:divalent metal transporter 1  chicken small intestine  nucleotide sequence  mRNA level
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