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核小体定位模式及其与DNA甲基化位点分布的关系
引用本文:刘宏德,孙啸.核小体定位模式及其与DNA甲基化位点分布的关系[J].中国生物化学与分子生物学报,2011,27(3):248-253.
作者姓名:刘宏德  孙啸
作者单位:东南大学生物电子学国家重点实验室;
基金项目:国家自然科学基金(No.30800209,61073141); 江苏省自然科学基金(No.SBK2010406)资助~~
摘    要:核小体定位是指DNA双螺旋相对于组蛋白八联体的位置.核小体定位通过限制蛋白结合位点参与基因转录调控.本文利用实验检测的人类CD4+ T细胞核小体定位数据,研究了核小体定位在转录因子结合位点(TFBS)和转录起始位点(TSS)附近的分布模式,并分析了在TFBS和TSS周围,核小体定位与DNA甲基化之间的关系.结果表明,在休眠和激活的人类CD4+ T细胞中,部分TFBS和TSS周围的核小体定位在动态改变,即在定位和缺失两种状态之间切换.在TFBS周围,核小体定位和DNA甲基化存在一种互补模式,核小体定位与DNA低甲基化相联系;而在TSS周围,两者呈现同步模式,DNA高甲基化伴随高核小体水平.而且,在TFBS和TSS周围,DNA甲基化位点的分布呈周期模式.CD4+ T细胞被激活时,较少的转录因子启动了较多的基因.

关 键 词:核小体定位  DNA甲基化  转录因子结合位点  转录起始位点  
收稿时间:2010-06-06

Patterns of Nucleosome Positioning and The Relationship between Positioning and DNA Methylation
LIU Hong-De,SUN Xiao.Patterns of Nucleosome Positioning and The Relationship between Positioning and DNA Methylation[J].Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology,2011,27(3):248-253.
Authors:LIU Hong-De  SUN Xiao
Institution:LIU Hong-De,SUN Xiao(State Key Laboratory of Bioelectronics,Southeast University,Nanjing 210096,China)
Abstract:
Keywords:
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