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麻疯树Jc-Tctp1基因的同源性分析及时空表达模式鉴定
引用本文:林莎,高帆,罗洪,牛蓓,林颖,秦小波,徐莺,陈放.麻疯树Jc-Tctp1基因的同源性分析及时空表达模式鉴定[J].中国生物化学与分子生物学报,2008,24(8).
作者姓名:林莎  高帆  罗洪  牛蓓  林颖  秦小波  徐莺  陈放
基金项目:国家自然科学基金,国家自然科学基金
摘    要:从麻疯树胚乳cDNA文库中获得了翻译调节肿瘤蛋白(translationally controlled tumor protein,TCTP)cDNA 序列,命名为 Jc-Tctp 1 (GenBank 登录号为EF091818).该序列全长1410 bp,开放阅读框由507个碱基组成.Jc-Tctp 1 编码的推测蛋白产物含有168个氨基酸残基,该蛋白具有典型的TCTP蛋白特点:由3个α螺旋组成α螺旋核心、4个β片层结构构成β片层核心,及微管结合结构域(MTB)和钙结合结构域(CaB).其推测氨基酸序列与巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)、油棕(Elaeis guineensis)、大豆(Glycine max)、水稻(Oryza sativa,japonica cultivar-group)、黑杨(Populus trichocarpa)、番茄(Lycopersicon esculentum)、西加云杉(Picea sitchensis)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)以及玉米(Zea may)的TCTP同源性依次为93%、90%、85%、84%、85%、84%、77%、80%和77%.经构建含Jc-TCTP1在内的植物TCTP蛋白分子进化树分析,发现单子叶植物并未按照其生物学分类的地位出现聚合.用半定量RT-PCR研究Jc-Tctp1 基因的表达模式,结果显示,其表达在转录水平上具有一定的组织和时间特异性,茎、I期胚乳、胚中最为丰富,而在Ⅱ期胚乳和花中表达最弱.

关 键 词:麻疯树  翻译调节肿瘤蛋白  生物信息学分析

Sequencing and Expression of Translationally Controlled Tumor Protein (TCTP) of Jatropha curcas L.
LIN Sha,GAO Fan,LUO Hong,NIU Bei,LIN Ying,QIN Xiao-Bo,XU Ying,CHEN Fang.Sequencing and Expression of Translationally Controlled Tumor Protein (TCTP) of Jatropha curcas L.[J].Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology,2008,24(8).
Authors:LIN Sha  GAO Fan  LUO Hong  NIU Bei  LIN Ying  QIN Xiao-Bo  XU Ying  CHEN Fang
Abstract:
Keywords:
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