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地衣的ITS序列系统发育分析和DNA条形码的初探
引用本文:柴华,沙伟.地衣的ITS序列系统发育分析和DNA条形码的初探[J].生物技术,2011,21(1).
作者姓名:柴华  沙伟
作者单位:齐齐哈尔大学生命科学与农林学院,黑龙江,齐齐哈尔,161006
基金项目:齐齐哈尔大学遗传工程重点实验室开放基金项目资助
摘    要:目的:构建出地衣植物核糖体rDNA(nrDNA)的ITS序列的系统发育树并探讨地衣植物的DNA条形码.方法:以黑龙江五大连池风景区的地衣植物为材料,采用特异性引物对地衣植物的ITS序列进行Pcr扩增,直接对其Pcr产物进行测序,利用MEGA4.0软件建立地衣植物的ITS序列的系统发育树.结果:根据系统发育分析得出一致性指数CI和维持性指数RI分别为0 5356和0.6602,相同属地衣的样本间即种内的遗传距离 和不同属的样本间即种间的遗传距离(K-2-P)平均值分别为0.030和0.600,种间距离大于种内距离.结论:根据地衣植物样本间的遗传距离(K-2-P)的分析,得出核糖体rDNA的ITS基因对地衣近缘属的分类鉴定上具有一定的参考价值,建议作为地衣分类鉴定的条形码的测试片段.

关 键 词:地衣  系统发育树  条形码

ITS Sequence for Phylogenetic Analysis of Lichens and DNA Barcoding
CHAI Hua,SHA Wei.ITS Sequence for Phylogenetic Analysis of Lichens and DNA Barcoding[J].Biotechnology,2011,21(1).
Authors:CHAI Hua  SHA Wei
Abstract:
Keywords:ITS
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