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甜瓜抗枯萎病基因同源序列克隆与序列分析
引用本文:李金玉,颜雪,黄琼,赵惠新,李冠.甜瓜抗枯萎病基因同源序列克隆与序列分析[J].生物技术,2006,16(3):3-9.
作者姓名:李金玉  颜雪  黄琼  赵惠新  李冠
作者单位:1. 新疆大学生命科学与技术学院,乌鲁木齐,830046
2. 新疆师范大学生命与环境科学学院,乌鲁木齐,830054
基金项目:新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(编号:200121105)
摘    要:目的:克隆甜瓜抗枯萎病基因同源序列并对其序列分析。方法:根据已发表的甜瓜抗枯萎病基因Fom-2设计引物,从高抗枯萎病甜瓜品种‘日本安农二号’基因组中扩增Fom-2同源序列R-Fom-2。结果:该基因长3307bp,包含一个完整的开放阅读框,编码1073个氨基酸,推测蛋白质分子量123.57kDa,等电点7.06。属于nonTIR-NBS-LRR类抗病基因,在LRR区存在一个可能的CC结构域。但在nonTIR类抗病蛋白中,CC结构域一般位于kin-1a前。氨基酸同源性分析显示,R-Fom-2同Fom-2全长序列具有96%的同源性,对不同甜瓜品种Fom-2的LRR区分析比较,同源性在91%以上。且LRR区的差异主要集中在β-strand/β-turn区域。结论:序列分析揭示Fom-2家族是一个活跃的基因,LRR区可能对Fom-2家族的功能起着重要作用,为进一步研究R-Fom-2基因的结构与生物学功能奠定了基础。

关 键 词:甜瓜  枯萎病  R-Fom-2基因  克隆
文章编号:1004-311X(2006)03-0003-07
收稿时间:2006-01-11
修稿时间:2006-04-12

Cloning and Sequence Analysis of Resistance to Fusarium wilt Gene Analogs from Melon (Cucumis melon L.)
LI Jin-Yu,YAN Xue,HUANG Qiong,ZHAO Hui-Xin,LI Guan.Cloning and Sequence Analysis of Resistance to Fusarium wilt Gene Analogs from Melon (Cucumis melon L.)[J].Biotechnology,2006,16(3):3-9.
Authors:LI Jin-Yu  YAN Xue  HUANG Qiong  ZHAO Hui-Xin  LI Guan
Institution:1 .College of Life Science and Technology, Xinjiang normal University, Urumqi 830046,China; 2. College of Life and Environment Science, Xinjiang University, Urumuqi 830054, China
Abstract:
Keywords:melon  Fusarium wilt  R-Fom-2 gene  cloning
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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