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不同牛种STAT5B基因启动子多态性分析
引用本文:赵顺林,杨永强,龚俞,焦仁刚,惠嫣婷,谢海强,肖希希,肖超能,刘若余.不同牛种STAT5B基因启动子多态性分析[J].生物技术,2012,22(6).
作者姓名:赵顺林  杨永强  龚俞  焦仁刚  惠嫣婷  谢海强  肖希希  肖超能  刘若余
作者单位:1. 贵州大学动物科学学院,高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵州贵阳550025
2. 贵州省畜牧技术推广站,贵州贵阳,550001
基金项目:贵州省重大科技专项计划项目
摘    要:目的:试验旨在筛选STAT5B基因启动子区SNP及研究其对启动子功能元件的影响,为地方牛种选种选育提供一定理论依据.方法:选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点.结果:STAT5B基因5'调控区及第1外显子存在3个SNPs位点,分别为:T-181C、C-31G、T+119C.生物信息学软件预测得到STAT5B基因核心启动子区和转录因子结合位点,SNP位点导致5个转录因子结合位点消失,而产生8个新的转录因子结合位点.软件未发现可能的CpG岛范围,但STAT5B基因RNA二级结构和最小自由能在突变后显著改变.结论:DNA池结合测序技术可快速筛选SNP位点,STAT5B启动子区存在功能性SNP位点.

关 键 词:STAT5B  SNP  启动子  贵州荷斯坦奶牛  务川黑牛

Study on the Polymorphism of Promoter Region of STAT5B Gene in Different Cattle Breeds
ZHAO Shun-lin , YANG Yong-qiang , GONG Yu , JIAO Ren-gang , HUI Yan-ting , XIE Hai-qiang , XIAO Xi-xi , XIAO Chao-neng , LIU Ruo-yu.Study on the Polymorphism of Promoter Region of STAT5B Gene in Different Cattle Breeds[J].Biotechnology,2012,22(6).
Authors:ZHAO Shun-lin  YANG Yong-qiang  GONG Yu  JIAO Ren-gang  HUI Yan-ting  XIE Hai-qiang  XIAO Xi-xi  XIAO Chao-neng  LIU Ruo-yu
Abstract:
Keywords:
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