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| 猪胸膜肺炎放线杆菌flic蛋白二级结构与B细胞表位预测 | |
| 引用本文： | 李任峰,田香勤,何启盖,赵坤,姜金庆,胡建和,王三虎.猪胸膜肺炎放线杆菌flic蛋白二级结构与B细胞表位预测[J].生物技术,2009,19(4):13-15. |
| 作者姓名： | 李任峰 田香勤 何启盖 赵坤 姜金庆 胡建和 王三虎 |
| 作者单位： | 1. 河南科技学院动物科学学院,河南,新乡,453003 2. 新乡医学院医学研究中心,河南,新乡,453003 3. 华中农业大学动物医学院,农业微生物学国家重点实验室动物病原分室,湖北,武汉,430070 |
| 基金项目： | 河南省基础与前沿研究项目，河南科技学院青年创新基金项目 |
| 摘 要： | 目的:预测和分析猪胸膜肺炎放线杆菌(Actionobacillus pleuropneumoniae,APP)鞭毛蛋白(flic)的二级结构和B细胞表位.方法:利用生物信息学方法对flic基因推导的氨基酸序列进行结构特征和B细胞表位预测分析.结果:flic蛋白为非稳定型脂蛋白,含有2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点(39-42 SirD,164-167 SvkD)和3个蛋白质激酶C磷酸化位点(39-41 SiR,161-163 TsR、164-166 SvK).该蛋白无信号肽,在21Ala～38Ala处存在跨膜区的可能性最大.fljc蛋白的二级结构主要由无规卷曲区域、α-螺旋和β-折叠组成,而形成较少的转角结构.该蛋白的B细胞表位可能位于55～61和152～158区段内或其附近区域.结论:预测结果将有助于确定file蛋白的B细胞表位,为进一步研究flic基因功能及研制APP基因工程疫苗提供参考. |
| 关 键 词： | 猪胸膜肺炎放线杆菌 二级结构 B细胞抗原表位 |
Prediction of Secondary Structure and B Cell Epitope for flic of Actionobacillus pleuropneumoniae |
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| LI Ren-feng,TIAN Xiang-qin,HE Qi-gai,ZHAO Kun,JIANG Jin-qing,HU Jian-he,WANG San-hu.Prediction of Secondary Structure and B Cell Epitope for flic of Actionobacillus pleuropneumoniae[J].Biotechnology,2009,19(4):13-15. | |
| Authors: | LI Ren-feng TIAN Xiang-qin HE Qi-gai ZHAO Kun JIANG Jin-qing HU Jian-he WANG San-hu |
| Institution: | LI Ren-feng1,TIAN Xiang-qin2,HE Qi-gai3,ZHAO Kun1,JIANG Jin-qing1,HU Jian-he1,WANG San-hu1*(1.Veterinary Medicine College,Henan Institute of Science and Technology,Xinxiang 45300,China,2.Medicine Research Center,Xinxiang Medical College,Xinxiang 453003,3.Division of Animal Infectious Disease,National Key Laboratory of Agricultural Microbiology,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070,China) |
| Abstract: | |
| Keywords: | Actionobacillus pleuropneumoniae secondary structure B-cell epitope |
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