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中国大陆野猪SLA DRB基因exon2的序列变异分析
引用本文:丁栋,沈菲菲,张保卫,李崇奇,张晨岭,周开亚,常青.中国大陆野猪SLA DRB基因exon2的序列变异分析[J].兽类学报,2008,28(2):117-125.
作者姓名:丁栋  沈菲菲  张保卫  李崇奇  张晨岭  周开亚  常青
作者单位:1. 南京师范大学生命科学学院遗传资源研究所,南京,210046
2. 安徽大学生命科学学院,合肥,230039
3. 海南医学院基础医学部,海口,571101
基金项目:江苏省生物多样性与生物技术重点实验室基金
摘    要:本文基于135头野猪样本中检测到的15种SLA DRB基因exon 2序列的遗传变异分析,探讨DRB基因在不同地理区域中自然选择的变化特征.研究发现DRB基因exon 2抗原结合位点的非同义替换率为同义替换率的2.95倍,表明该位点受到平衡选择的强烈作用.在系统发生分析中,在基于核苷酸序列构建的NJ树中,野猪DRB位点的15种等位基因全部聚为一枝,没有发现跨种多态现象;而在基于氨基酸序列构建的系统发生树中,野猪SLA-DRB*nnu6和人DRB基因exon 2片段聚在一起,这种氨基酸残基的高度相似可能是由于自然选择压力下产生的趋同.野猪DRB基因exon 2的序列多态性分析表明,东北野猪基因多态性低于四川野猪和华南野猪,这可能与不同气候条件和地理环境下的寄生虫等因素对SLA等位基因变异的影响存在差异有关.

关 键 词:野猪  DRB  exon  2  遗传变异  平衡选择  系统发生  中国  大陆  东北野猪  基因变异  序列多态性  变异分析  wild  Chinese  exon  antigen  lymphocyte  swine  variation  Sequence  差异  存在  影响  因素  寄生虫  地理环境
文章编号:1000-1050(2008)02-0117-09
修稿时间:2007年9月12日

Sequence variation at the swine lymphocyte antigen locus DRB exon 2 in Chinese wild boars(Sus scrofa)
DING Dong,SHEN Feifei,ZHANG Baowei,LI Chongqi,ZHANG Chenling,ZHOU Kaiya,CHANG Qing.Sequence variation at the swine lymphocyte antigen locus DRB exon 2 in Chinese wild boars(Sus scrofa)[J].Acta Theriologica Sinica,2008,28(2):117-125.
Authors:DING Dong  SHEN Feifei  ZHANG Baowei  LI Chongqi  ZHANG Chenling  ZHOU Kaiya  CHANG Qing
Abstract:
Keywords:
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