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犬冠状病毒大熊猫株纤突蛋白全基因的克隆与序列分析
引用本文:乔军,夏成柱,胡桂学,谢之景,闫芳,杨松涛,黄耕.犬冠状病毒大熊猫株纤突蛋白全基因的克隆与序列分析[J].Virologica Sinica,2004,19(5):481-486.
作者姓名:乔军  夏成柱  胡桂学  谢之景  闫芳  杨松涛  黄耕
作者单位:[1]塔里木农垦大学动物科技学院,新疆阿拉尔843300 [2]中国人民解放军军事医学科学院军事兽医研究所,吉林长春130062 [3]吉林农业大学动物科技学院,吉林长春130118
基金项目:国家自然科学基金(30000123)~~
摘    要:在国内首次对犬冠状病毒大熊猫野毒株(CCVDXMV)纤突蛋白基因进行了克隆和序列测定。该基因全长4362bp,编码1453个氨基酸,N端前18个氨基酸为推测的信号肽序列,后1435个氨基酸构成成熟蛋白。与GenBank中已发表的11个CCV毒株s基因相比,s基因核苷酸序列同源性在40.2%-99.5%之间;推导的氨基酸序列同源性在15.9%-99.O%之间。DXMV株s基因变异区主要集中在该基因前1/2处,其中350.370、439.478、1718.1818三个区域碱基变异较大,而1060.1700区却十分保守。基于s全基因及其蛋白的聚类分析表明,DXMV株与K378、NVSL和USpatent株亲源关系最近。推导的DXMV株s蛋白氨基酸序列潜在的N-联糖基化位点与CCV强毒V54相同,为34个,比Insavc.1弱毒多一个;其中第566.568位糖基化位点为多数强毒拥有而弱毒没有的。另外,DXMV株S蛋白疏水性及抗原表位与其它毒株有一定的差异,这些差异对DXMV株致病性和免疫原性等影响尚待进一步的研究。

关 键 词:犬冠状病毒大熊猫株  纤突蛋白基因  克隆  序列分析

Cloning and SequenceAnalysis of Spike Protein Gene of Canine Coronavirus Giant Panda's Isolate
QIAO Jun,XIAXian-zhu,HU Gui-xue,XIE Zhi-jing,YAN Fan,YANG Song-tao,HUANG Gen.Cloning and SequenceAnalysis of Spike Protein Gene of Canine Coronavirus Giant Panda's Isolate[J].中国病毒学(英文版),2004,19(5):481-486.
Authors:QIAO Jun    XIAXian-zhu  HU Gui-xue  XIE Zhi-jing  YAN Fan  YANG Song-tao  HUANG Gen
Institution:QIAO Jun1,3,XIAXian-zhu1**,HU Gui-xue2,XIE Zhi-jing1,YAN Fan1,YANG Song-tao1,HUANG Gen1
Abstract:
Keywords:
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