| SARS病毒与其他冠状病毒的基因组比较 |
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| 引用本文： | 孙啸,谢建明,周士新,谢雪英,陆祖宏.SARS病毒与其他冠状病毒的基因组比较[J].Virologica Sinica,2003,18(4):335-339. |
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| 作者姓名： | 孙啸 谢建明 周士新 谢雪英 陆祖宏 |
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| 作者单位： | 东南大学生物科学与医学工程系，东南大学生物科学与医学工程系，东南大学生物科学与医学工程系，东南大学生物科学与医学工程系，东南大学生物科学与医学工程系 江苏南京 210096，江苏南京 210096，江苏南京 210096，江苏南京 210096，江苏南京 210096 |
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| 基金项目： | 国家高技术计划(863)资助项目(2002AA231071)，江苏省自然科学基金(BK2002057) |
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| 摘 要： | 本文利用生物信息学方法比较SARS病毒和其他冠状病毒基因组。通过数据库搜索，找出与SARS病毒基因组相似的核酸或蛋白质序列，并对相似序列进行比对，分析它们的共性和差异。结果表明，SARS病毒在基因组的组织上及结构蛋白质方面与现有冠状病毒有比较大的相似性，SARS病毒基因组与冠状病毒基因组相关。但是，SARS病毒基因组还存在一些特异性序列，ORF1a和S蛋白(特别是S1)的变化以及SARS—CoV特异性的非结构蛋白可能是SARS发病机理与传染特性区别于其他冠状病毒的分子基础。在全基因组水平上进行核酸单词出现频率分析，结果表明，SARS病毒远离已知的其他冠状病毒，单独成为一类。
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| 关 键 词： | SARS病毒 冠状病毒 基因组 比较 |
Genome Comparison Between SARS-associated coronavirus and Other Coronaviruses |
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| SUN Xiao,XIE Jian-ming,ZHOU Shi-xin,XIE Xue-ying,LU Zu-hong.Genome Comparison Between SARS-associated coronavirus and Other Coronaviruses[J].中国病毒学(英文版),2003,18(4):335-339. |
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| Authors: | SUN Xiao XIE Jian-ming ZHOU Shi-xin XIE Xue-ying LU Zu-hong |
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| Abstract: | The genome sequences of SARS-associated coronavirus (SARS-CoV) were compared with other Coronaviruses. Similar sequences were found by searching biomolecular databases. Sequence analysis showed that SARS-CoV had similar genomic organization and structural proteins while compared with other Coronaviruses. SARS-CoV is related to other known Coronaviruses. But there were some specific sequences in SARS-CoV genome. The virulence of SARS may derive from variations of ORF1a and S protein and the specificity of some nonstructural proteins. The result of word frequency analysis indicated that SARS-CoV does not closely resemble any of known Coronaviruses. |
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| Keywords: | SARS-associated coronavirus(SARS-CoV) Coronavirus Genomics Sequence Analysis |
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