| 猪内源性反转录病毒5′端非编码区的克隆及结构分析 |
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| 引用本文： | 吴健敏,阳玉彪,吕茂民,谢放,郭艳茹,章金刚.猪内源性反转录病毒5′端非编码区的克隆及结构分析[J].Virologica Sinica,2005,20(5):522-525. |
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| 作者姓名： | 吴健敏 阳玉彪 吕茂民 谢放 郭艳茹 章金刚 |
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| 作者单位： | 军事医学科学院输血医学研究所，军事医学科学院输血医学研究所，军事医学科学院输血医学研究所，军事医学科学院输血医学研究所，军事医学科学院输血医学研究所，军事医学科学院输血医学研究所 北京100850 广西兽医研究所，广西南宁530001，北京100850，北京100850，北京100850，北京100850，北京100850 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(30270989)，北京市自然科学基金(5032015)，中国博士后基金(2003033195)资助项目 |
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| 摘 要： | 通过五指山猪内源性反转录病毒5′端非编码区(5′UTR)cDNA的克隆,分析其一级结构和调控元件,为进一步研究其在PERV复制、转录中的调控机制奠定基础。本研究采用cDNA末端快速扩增技术(RACE)获得全长约1035bp的PERV 5′UTR。通过NCBI公共数据库BLASTn序列进行同源性分析,并应用KEGG数据库对该转录调控区进行顺式作用元件定位分析,结果发现PERV 5′UTR与GenBank公布的部分PERV 5′UTR相比较,同源性在82.6~94.8%之间。一级结构分析发现PERV 5′UTR由U3、R、U5区、引物结合区(PBS)及前导序列组成,可能的核心启动子序列与具有增强子作用的39bp重复序列分别位于U3区的-67~ 1与-97~-59区段。在5′UTR转录调控区(-428~ 507)鉴定出31个有效的顺式作用元件位点,其中NF-Y、TBP、Oct-1、HSF、GATA-1和GATA-2等与PERV的转录、调控密切相关。
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| 关 键 词： | PERV猪内源性反转录病毒 五指山猪 5′端非编码区 一级结构 顺式作用元件 |
| 收稿时间： | 2005-04-11 |
| 修稿时间： | 2005-05-26 |
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