越橘属植物EST-SSR分子标记开发及遗传多样性分析 |
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引用本文: | 孙海悦,郭瑞雪,徐鉴,田友文,董梅,董坤,李亚东.越橘属植物EST-SSR分子标记开发及遗传多样性分析[J].植物生理学报,2018(3). |
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作者姓名: | 孙海悦 郭瑞雪 徐鉴 田友文 董梅 董坤 李亚东 |
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作者单位: | 吉林农业大学园艺学院 |
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摘 要: | 以84份越橘种质为材料,从NCBI公共数据库下载22 402条越橘属(Vaccinium)EST序列,通过CAP3组装软件将EST序列拼接成11 541条unigene序列,其中2 076条unigene序列含有2 679个SSR位点。二核苷酸和三核苷酸重复是主要的SSR类型,约占SSR总数的96.01%。利用Primer Premier 5.0软件设计81对引物,其中55对引物在供试越橘种质中扩增出理想的PCR产物,55对引物均有多态性。聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.70时,可以将供试越橘种质分成两大类。越橘EST-SSR标记可以用于种质鉴定与遗传多样性分析。
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