藏红花柱头小RNA高通量测序及生物信息学分析 |
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引用本文: | 卢晓慧,朱志明,岳俊阳.藏红花柱头小RNA高通量测序及生物信息学分析[J].植物生理学报,2018(5). |
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作者姓名: | 卢晓慧 朱志明 岳俊阳 |
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作者单位: | 嘉兴职业技术学院信息技术分院;安徽农业大学园艺学院;嘉兴天禾藏红花专业合作社;合肥工业大学食品科学与工程学院 |
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摘 要: | 通过构建藏红花开花前2 d与开花日两个不同时期柱头的小RNA文库并进行高通量测序,分别获得3 711 809和2 303 043条序列。借助生物信息学的方法,共鉴定出164条保守的mi RNA。其中,随开花过程下调表达和上调表达的mi RNA分别是71和46条。靶基因预测及功能富集分析显示它们可能参与了硫辛酸生物合成、细胞程序性凋亡、花粉细胞的分化、脱落酸介导的信号途径等生物过程。本文筛选的藏红花成熟过程中的mi RNA为今后脱辅基类胡萝卜素代谢调控网络的研究提供了可能的线索。
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