| 大豆基因家族的结构和表达分析 |
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| 引用本文： | 李方正,杨素欣一,吴春霞,魏海超,曲瑞莲,冯献忠.大豆基因家族的结构和表达分析[J].植物学通报,2012(3):236-247. |
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| 作者姓名： | 李方正 杨素欣一 吴春霞 魏海超 曲瑞莲 冯献忠 |
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| 作者单位： | 山东师范大学生命科学学院,山东省高校系统生物学重点实验室,济南250014 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金重大研究计划（No.91131008）和山东省自然科学杰出青年基金（N0_JQ200909） |
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| 摘 要： | KNOX基因家族编码同源异型盒蛋白，在植物生长发育过程中起重要调控作用。利用生物信息学手段在全基因组水平上对大豆（Glycine Max）KNOX）（家族基因进行鉴定和分类，并分析其基因结构、蛋白同源结构域特征以及基因表达方式。研究结果表明：大豆中的27个GmKNOX基因可以分为GmKNOXl和GmKNOXll两个亚类，其中GmKNOXl类可分为3个主要的进化支，GmKNOXll类分为2个主要的进化支：26个GmKNOX基因不均匀地分布在16条染色体上，GmKNOX27尚无法定位。不同组织表达谱的分析表明：GmKNOXl类基因表达部位比较集中，以茎顶端分生组织中表达量最高：而GmKNOXll类基因的表达特异性较GmKNOXl类低，表达部位更广泛。
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| 关 键 词： | 基因家族 基因结构 表达分析 大豆 同源结构域 生长发育过程 顶端分生组织 基因表达 |
Structure and Expression Analysis of KNOX Gene Family in Soybean |
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| Abstract: | KNOX family genes, coding homeobox proteins, play an important role in plant development. We investigated soybean KNOX family genes with genome database analysis and bioinformatics. Phylogenetic analysis characterized 2 classes of GmKNOXgenes： GmKNOXl with 3 sub-classes and GmKNOXll with 2. In total, 26 GmKNOXgenes distribute in 16 chromosomes of soybean, and GmKNOX27 could not be located in any chromosome. Whole-genome expression analysis revealed cass l GmKNOXgenes mainly expressed in meristematic tissues and class ll GmKNOXgenes broadly expressed in different tissues. |
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| Keywords: | expression profiles gene structure KNOX gene family soybean |
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