棉花叶绿体基因RNA编辑位点的测定及分析 |
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引用本文: | 江媛,范术丽,宋美珍,俞嘉宁,喻树迅.棉花叶绿体基因RNA编辑位点的测定及分析[J].植物学通报,2011,46(4):386-395. |
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作者姓名: | 江媛 范术丽 宋美珍 俞嘉宁 喻树迅 |
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作者单位: | 1. 陕西师范大学生命科学学院,西安,710062 2. 中国农业科学院棉花研究所/农业部棉花遗传改良重点实验室,安阳,455000 |
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基金项目: | 国家重点基础研究发展计划项目,转基因生物新品种培育项目 |
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摘 要: | 陆生植物叶绿体RNA编辑是转录后基因表达调控的一种重要方式。该文在预测棉花(Gossypium hirsutum)叶绿体基因RNA编辑位点的基础上,选取中棉10(CRRI 10)为实验材料,采用PCR、RT-PCR及测序等方法,确定CRRI 10的27个叶绿体蛋白编码基因共有55个编辑位点,均是C→U的转换。与棉种柯字310(C310)的编辑位点比对后发现,CRRI 10多出accD-468和rpoC1-163两个编辑位点,同时缺失psbN-10。利用生物信息学分析这3个位点,rpoC1-163和psbN-10的编辑可能会改变各自蛋白的二级结构。对CRRI 10中55个编辑位点上游的顺式作用元件(?30–?1)分析显示,共有8组顺式作用元件的相似性达到60%或以上,推测各组中的编辑位点可能由相同的反式作用因子来识别。
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关 键 词: | 叶绿体 顺式作用元件 棉花 RNA编辑 |
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