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空间飞行水稻pi-hit-1基因启动子功能分析
引用本文:张萌,梁书剑,程震龙,关双红,黄磊,孙野青.空间飞行水稻pi-hit-1基因启动子功能分析[J].生物学杂志,2011,28(2):1-4,24.
作者姓名:张萌  梁书剑  程震龙  关双红  黄磊  孙野青
作者单位:1. 哈尔滨工业大学航天学院航空宇航科学与技术,哈尔滨,150001
2. 大连海事大学环境系统生物学研究所,大连,116026;哈尔滨工业大学理学院生命科学与工程系,哈尔滨,150001
3. 哈尔滨工业大学理学院生命科学与工程系,哈尔滨,150001
4. 大连海事大学环境系统生物学研究所,大连,116026
5. 哈尔滨工业大学航天学院航空宇航科学与技术,哈尔滨,150001;大连海事大学环境系统生物学研究所,大连,116026
摘    要:pi-hit-1基因是本实验室通过空间诱变找到的一个水稻新基因。为了对pi-hit-1基因启动子结构和功能进行研究,首先使用植物启动子分析数据库(PlantProm DB-TSSP,TFSEARCH,PLACE及PlantCARE)对该基因转录调控区序列进行预测分析,结果显示该基因上游调控区存在多个顺式元件,主要集中在翻译起始位点前300bp的区域,转录起始位点位于翻译起始位点前100bp,在转录起始位点前132bp存在TATA box元件。凝胶电泳迁移率实验(EMSA)发现翻译起始位点上游约300bp存在转录因子特异结合位点,为该基因的核心启动子,这与预测结果一致。采用系统生物学的方法研究水稻新基因pi-hit-1启动子结构,发现了该基因的核心启动子元件,为研究空间环境如何影响基因的转录调控提供了重要依据。

关 键 词:空间飞行  基因  水稻  pi-hit-1基因  启动子  凝胶电泳迁移率实验

Function analysis of space flight rice pi-hit-1 gene promoter
ZHANG Meng,LIANG Shu-jian,CHENG Zhen-long,GUAN Shuang-hong,HUANG Lei,SUN Ye-qing.Function analysis of space flight rice pi-hit-1 gene promoter[J].Journal of Biology,2011,28(2):1-4,24.
Authors:ZHANG Meng  LIANG Shu-jian  CHENG Zhen-long  GUAN Shuang-hong  HUANG Lei  SUN Ye-qing
Institution:1.School of Astronautics,Harbin Institute of Technology,Harbin 150001;2.Institute of Environmental System Biology,Dalian Maritime University,Dalian 116026;3.School of Science,Harbin Institute of Technology,Harbin 150001,China)
Abstract:
Keywords:space flight  genes  rice  pi-hit-1 gene  promoter  EMSA
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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