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若尔盖湿地青海沙蜥红原亚种线粒体ND4-tRNAleu基因的序列变异和遗传多样性
引用本文:刘莉,郭宪光,王跃招.若尔盖湿地青海沙蜥红原亚种线粒体ND4-tRNAleu基因的序列变异和遗传多样性[J].动物学研究,2008,29(2):121-126.
作者姓名:刘莉  郭宪光  王跃招
作者单位:1. 中国科学院成都生物研究所,四川成都610041;中国科学院研究生院,北京100049
2. 中国科学院成都生物研究所,四川成都,610041
基金项目:国家自然科学基金 , 科技部科技基础条件平台建设计划 , 中国科学院知识创新工程青年人才领域前沿项目
摘    要:研究了青海沙蜥红原亚种(Phrynocephalus vlangalii hongyuanensis)分布于四川若尔盖辖曼(XM)、红原(HY)和甘肃玛曲(MQ)这3个地理单元7个居群的ND4-tRNAleu基因的序列变异和遗传多样性。72个序列比对得到785bp的片断,含变异位点7个,定义了9种单倍型。结果显示7个居群总的核苷酸多样性较低(0.00231±0.00016),单倍型多样性较高(0.806±0.024);就单个居群而言,MQa、MQb、XMb的遗传多样性低,XMc相对较高。各居群间的Kimura双参数遗传距离小(0.001—0.005),最大遗传距离出现在MQa和XMa之间,XM单元各居群之间遗传距离最小。但分子变异分析(AMOVA)显示3个单元间出现了显著差异(P<0.01),遗传变异主要存在于地理单元间,占62.61%。除MQ单元形成一支,单倍型网络图没有显示出单倍型和地理位置的对应关系,XM各居群以及HY混杂在一起。XM单元单倍型的不配对分布(Mismatch distribution)为明显左移的单峰,同时Fu’sFstest得到负值(Fs=-2.21937),这都暗示XM单元可能经历了近期种群扩张,这是其单倍型多样性较高和核苷酸多样性较低的原因。MQ单元遗传多样性低而与其他单元显著分化,推测与黄河在若尔盖玛曲之间贯通有关。近期沼泽的形成对XMb的隔离时间短,使得其遗传多样性低但还不足以形成大的遗传差异。

关 键 词:青海沙蜥红原亚种  遗传多样性  序列变异  若尔盖湿地
文章编号:0254-5853-(2008)02-0121-06
收稿时间:2007-10-18
修稿时间:2007年10月18

Genetic Variation and Diversity of Phrynocephalus vlangalii hongyuanensis in Zoige Wetland Inferred from ND4-tRNAleu Gene
LIU Li,GUO Xian-guang,WANG Yue-zhao.Genetic Variation and Diversity of Phrynocephalus vlangalii hongyuanensis in Zoige Wetland Inferred from ND4-tRNAleu Gene[J].Zoological Research,2008,29(2):121-126.
Authors:LIU Li  GUO Xian-guang  WANG Yue-zhao
Abstract:
Keywords:Phrynocephalus vlangalii hongyuanensis  Genetic diversity  Sequence variation  Zoige Wetland
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