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树鼩IL-2全长编码序列的克隆及分子特征分析
引用本文:黄晓燕,李明利,徐娟,高跃东,王文广,殷安国,李晓飞,孙晓梅,夏雪山.树鼩IL-2全长编码序列的克隆及分子特征分析[J].动物学研究,2013,34(2):121-126.
作者姓名:黄晓燕  李明利  徐娟  高跃东  王文广  殷安国  李晓飞  孙晓梅  夏雪山
作者单位:1. 中国医学科学院/北京协和医学院 医学生物学研究所 树鼩种质资源中心 云南省重大传染病疫苗研发重点实验室,云南昆明,650118
2. 中国科学院昆明动物研究所 动物模型与人类疾病机理重点实验室:免疫生物学实验室,云南昆明,650223
3. 中国科学院昆明生物多样性大型仪器区域中心,云南昆明650223;中国科学院昆明动物研究所 遗传资源与进化国家重点实验室,云南昆明650223
4. 昆明理工大学 生命科学与技术学院,云南昆明,650500
基金项目:国家科技支撑计划项目,云南省科技计划重点项目,云南省应用基础面上项目
摘    要:树鼩作为多种人类疾病模型已受到广泛关注,而免疫因子对于树鼩模型评价至关重要,但目前对其白细胞介素-2(IL-2)的研究鲜有报道。该实验以经ConA(concanavalin)诱导培养的树鼩淋巴细胞总RNA为模板,RT-PCR克隆出465bp的树鼩IL-2全长编码序列,并采用ClustalW软件分析其序列和分子特征。结果表明树鼩IL-2cDNA编码一个由154个氨基酸组成的蛋白质,其cDNA及氨基酸序列与人的同源性分别为93%及80%,且其整体结构与人IL-2相似。MEGA5.0软件构建的进化树表明,树鼩与人及恒河猴的亲缘关系较近。Pymol软件对树鼩和人IL-2氨基酸序列进行的三维结构模建表明,两者的IL-2分子三维空间结构基本相似,表面大部分区域所带电荷相同,但在某些区域差异较大,且树鼩多出一个糖基化位点,这些差异对抗体的结合可能存在影响。该研究为今后树鼩IL-2单克隆抗体的制备及功能研究奠定了基础。

关 键 词:树鼩  IL-2  克隆  结构  功能

Analysis of the molecular characteristics and cloning of full-length coding sequence of Interleukin-2 in tree shrews
Xiao-Yan HUANG,Ming-Li LI,Juan XU,Yue-Dong GAO,Wen-Guang WANG,An-Guo YIN,Xiao-Fei LI,Xiao-Mei SUN,Xue-Shan XIA,Jie-Jie DAI.Analysis of the molecular characteristics and cloning of full-length coding sequence of Interleukin-2 in tree shrews[J].Zoological Research,2013,34(2):121-126.
Authors:Xiao-Yan HUANG  Ming-Li LI  Juan XU  Yue-Dong GAO  Wen-Guang WANG  An-Guo YIN  Xiao-Fei LI  Xiao-Mei SUN  Xue-Shan XIA  Jie-Jie DAI
Institution:1,*1. Center of Tree Shrew Germplasm Resources , Institute of Medical Biology, the Chinese Academy of Medical Science and Peking Union Medical College, Yunnan Key Laboratory of Vaccine Research and Development on Severe Infectious Diseases. Kunming 650118, China; 2. Immunobiology Laboratory, Key Laboratory of Animal Models and Human Disease Mechanisms, Kunming Institute of Zoology, the Chinese Academy of Science, Kunming 650223, China; 3. Kunming Biological Diversity Regional Center of Large Apparatus and Equipment, the Chinese Academy of Sciences, Kunming 650223, China; 4. State Key Laboratory of Genetic Resources and Evolution, Kunming Institute of Zoology, the Chinese Academy of Sciences, Kunming 650223, China; 5. Faculty of Life Science and Technology, Kunming University of Science and Technology, Kunming 650500, China
Abstract:
Keywords:
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