鱼类线粒体DNA重排研究进展

一般认为鱼类线粒体基因组在结构上具有高度的保守性,但是通过分析NCBI数据库中的1 255种鱼类线粒体基因组全序列(截至2013年11月3日),发现~52种鱼线粒体基因组发生了重排。进一步的分析发现这些重排具有3种类型:滑移(shuffling)、移位(translocation)和倒置(inversion),并多发生于WANCY基因簇、IQM基因簇、ND6基因、控制区(D-loop)及其邻接基因等区域。该文根据已报道的4种常见的解释重排的模型:复制随机丢失(duplication-random loss)、复制非随机丢失(duplication-nonrandom loss)、线粒体内的重组(intramitochondrial recombination)以及由tRNA基因错误起始引起的复制(tRNAmiss-priming model)解释了鱼类重排产生的可能机制,并探讨了重排现象在鱼类系统发生研究中的应用,以期为鱼类线粒体的进化研究提供科学依据。