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水葫芦根际细菌群落结构多样性分析
引用本文:郑李军,傅明辉.水葫芦根际细菌群落结构多样性分析[J].微生物学通报,2015,42(11):2115-2125.
作者姓名:郑李军  傅明辉
作者单位:广东工业大学 轻工化工学院 广东 广州 510006,广东工业大学 轻工化工学院 广东 广州 510006
基金项目:国家自然科学基金项目(No. 21177029)
摘    要:【目的】了解水葫芦根际细菌群落结构。【方法】运用末端限制性片段长度多态性(Terminal restriction fragment length polymorphism,T-RFLP)技术分析富营养化水体中水葫芦根际和水葫芦近、远水样的细菌群落特征及多样性,结合克隆文库技术和培养法分析根际的细菌种群类型。【结果】同一时期水葫芦根际细菌多样性(Shannon-Weiner指数H′或Simpson指数D)更高,水葫芦近水样次之,远水样最小。10月份的细菌多样性高于5月份的。通过水葫芦根际细菌的克隆文库可知变形杆菌门(Proteobacteria)是水葫芦根际细菌的主要类群,占总群体的65.1%,包括噬菌弧菌(Bacteriovorax sp.)、Dechloromonas sp.、Leptothrix sp.、红螺菌科(Rhodospirillaceae)、Rhodoferax sp.和红环菌科(Rhodocyclaceae)等。T-RFLP图谱显示159 bp为最大优势菌,247 bp为第二大优势菌,对照克隆文库及培养结果分析247 bp属于γ-Proteobacteria,159 bp为不动杆菌(Acinetobacter sp.)。【结论】水葫芦根际细菌的群落结构丰富,不同时段水葫芦根际细菌的丰度略有变化,主要类群为变形杆菌门。

关 键 词:末端限制性片段长度多态性,克隆文库技术,富营养化水体,水葫芦根际细菌

Analysis of the diversity of bacterial community structure in the rhizosphere of Eichhornia crassipes
ZHENG Li-Jun and FU Ming-Hui.Analysis of the diversity of bacterial community structure in the rhizosphere of Eichhornia crassipes[J].Microbiology,2015,42(11):2115-2125.
Authors:ZHENG Li-Jun and FU Ming-Hui
Institution:Faculty of Light Industry and Chemical Engineering, Guangdong University of Technology, Guangzhou, Guangdong 510006, China and Faculty of Light Industry and Chemical Engineering, Guangdong University of Technology, Guangzhou, Guangdong 510006, China
Abstract:
Keywords:Terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP)  Clone library technique  Eutrophic water  Rhizosphere bacteria of E  crassipes
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